Protein–RNA interactions for Protein: P52019

Sqle, Squalene monooxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SqleP52019 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SqleP52019 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SqleP52019 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SqleP52019 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SqleP52019 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SqleP52019 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SqleP52019 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SqleP52019 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SqleP52019 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SqleP52019 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SqleP52019 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SqleP52019 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SqleP52019 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SqleP52019 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SqleP52019 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SqleP52019 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SqleP52019 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SqleP52019 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SqleP52019 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SqleP52019 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SqleP52019 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SqleP52019 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SqleP52019 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SqleP52019 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SqleP52019 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SqleP52019 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SqleP52019 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SqleP52019 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SqleP52019 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SqleP52019 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SqleP52019 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SqleP52019 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SqleP52019 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SqleP52019 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SqleP52019 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SqleP52019 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SqleP52019 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SqleP52019 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SqleP52019 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SqleP52019 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SqleP52019 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SqleP52019 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SqleP52019 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SqleP52019 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SqleP52019 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SqleP52019 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SqleP52019 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SqleP52019 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SqleP52019 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SqleP52019 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SqleP52019 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SqleP52019 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SqleP52019 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SqleP52019 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SqleP52019 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SqleP52019 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SqleP52019 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SqleP52019 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SqleP52019 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SqleP52019 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SqleP52019 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SqleP52019 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SqleP52019 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SqleP52019 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SqleP52019 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SqleP52019 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SqleP52019 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SqleP52019 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SqleP52019 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SqleP52019 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SqleP52019 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SqleP52019 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SqleP52019 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SqleP52019 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SqleP52019 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SqleP52019 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SqleP52019 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SqleP52019 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SqleP52019 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SqleP52019 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SqleP52019 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SqleP52019 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SqleP52019 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SqleP52019 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SqleP52019 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SqleP52019 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SqleP52019 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SqleP52019 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SqleP52019 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SqleP52019 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SqleP52019 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SqleP52019 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SqleP52019 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SqleP52019 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SqleP52019 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SqleP52019 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SqleP52019 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SqleP52019 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SqleP52019 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SqleP52019 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms