Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Defa-rs12P50716 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Defa-rs12P50716 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Defa-rs12P50716 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Defa-rs12P50716 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Defa-rs12P50716 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Defa-rs12P50716 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Defa-rs12P50716 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Defa-rs12P50716 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Defa-rs12P50716 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Defa-rs12P50716 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Defa-rs12P50716 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Defa-rs12P50716 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Defa-rs12P50716 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Defa-rs12P50716 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Defa-rs12P50716 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Defa-rs12P50716 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Defa-rs12P50716 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Defa-rs12P50716 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Defa-rs12P50716 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Defa-rs12P50716 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Defa-rs12P50716 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Defa-rs12P50716 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Defa-rs12P50716 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Defa-rs12P50716 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Defa-rs12P50716 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Defa-rs12P50716 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Defa-rs12P50716 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Defa-rs12P50716 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Defa-rs12P50716 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Defa-rs12P50716 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Defa-rs12P50716 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Defa-rs12P50716 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Defa-rs12P50716 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Defa-rs12P50716 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Defa-rs12P50716 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Defa-rs12P50716 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Defa-rs12P50716 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Defa-rs12P50716 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Defa-rs12P50716 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Defa-rs12P50716 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Defa-rs12P50716 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Defa-rs12P50716 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Defa-rs12P50716 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Defa-rs12P50716 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Defa-rs12P50716 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Defa-rs12P50716 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Defa-rs12P50716 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Defa-rs12P50716 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Defa-rs12P50716 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Defa-rs12P50716 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Defa-rs12P50716 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Defa-rs12P50716 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Defa-rs12P50716 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Defa-rs12P50716 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Defa-rs12P50716 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Defa-rs12P50716 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Defa-rs12P50716 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Defa-rs12P50716 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Defa-rs12P50716 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Defa-rs12P50716 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Defa-rs12P50716 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Defa-rs12P50716 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Defa-rs12P50716 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Defa-rs12P50716 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Defa-rs12P50716 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Defa-rs12P50716 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Defa-rs12P50716 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Defa-rs12P50716 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Defa-rs12P50716 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Defa-rs12P50716 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Defa-rs12P50716 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Defa-rs12P50716 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Defa-rs12P50716 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Defa-rs12P50716 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Defa-rs12P50716 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Defa-rs12P50716 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Defa-rs12P50716 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Defa-rs12P50716 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Defa-rs12P50716 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Defa-rs12P50716 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Defa-rs12P50716 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Defa-rs12P50716 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Defa-rs12P50716 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Defa-rs12P50716 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Defa-rs12P50716 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Defa-rs12P50716 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Defa-rs12P50716 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Defa-rs12P50716 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Defa-rs12P50716 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Defa-rs12P50716 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Defa-rs12P50716 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Defa-rs12P50716 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Defa-rs12P50716 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Defa-rs12P50716 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Defa-rs12P50716 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Defa-rs12P50716 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Defa-rs12P50716 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Defa-rs12P50716 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Defa-rs12P50716 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms