Protein–RNA interactions for Protein: P50715

Defa-rs7, Alpha-defensin-related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs7P50715 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Defa-rs7P50715 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Defa-rs7P50715 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Defa-rs7P50715 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Defa-rs7P50715 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Defa-rs7P50715 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Defa-rs7P50715 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Defa-rs7P50715 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Defa-rs7P50715 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Defa-rs7P50715 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Defa-rs7P50715 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Defa-rs7P50715 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Defa-rs7P50715 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Defa-rs7P50715 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Defa-rs7P50715 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Defa-rs7P50715 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Defa-rs7P50715 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Defa-rs7P50715 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Defa-rs7P50715 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Defa-rs7P50715 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Defa-rs7P50715 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Defa-rs7P50715 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Defa-rs7P50715 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Defa-rs7P50715 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Defa-rs7P50715 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Defa-rs7P50715 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Defa-rs7P50715 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Defa-rs7P50715 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Defa-rs7P50715 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Defa-rs7P50715 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Defa-rs7P50715 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Defa-rs7P50715 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Defa-rs7P50715 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Defa-rs7P50715 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Defa-rs7P50715 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Defa-rs7P50715 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Defa-rs7P50715 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Defa-rs7P50715 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Defa-rs7P50715 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Defa-rs7P50715 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Defa-rs7P50715 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Defa-rs7P50715 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Defa-rs7P50715 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Defa-rs7P50715 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Defa-rs7P50715 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Defa-rs7P50715 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Defa-rs7P50715 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Defa-rs7P50715 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Defa-rs7P50715 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Defa-rs7P50715 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Defa-rs7P50715 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Defa-rs7P50715 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Defa-rs7P50715 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Defa-rs7P50715 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Defa-rs7P50715 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Defa-rs7P50715 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Defa-rs7P50715 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Defa-rs7P50715 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Defa-rs7P50715 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Defa-rs7P50715 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Defa-rs7P50715 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Defa-rs7P50715 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Defa-rs7P50715 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Defa-rs7P50715 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Defa-rs7P50715 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Defa-rs7P50715 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Defa-rs7P50715 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Defa-rs7P50715 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Defa-rs7P50715 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Defa-rs7P50715 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Defa-rs7P50715 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Defa-rs7P50715 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Defa-rs7P50715 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Defa-rs7P50715 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Defa-rs7P50715 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Defa-rs7P50715 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Defa-rs7P50715 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Defa-rs7P50715 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Defa-rs7P50715 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Defa-rs7P50715 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Defa-rs7P50715 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Defa-rs7P50715 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Defa-rs7P50715 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Defa-rs7P50715 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Defa-rs7P50715 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Defa-rs7P50715 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Defa-rs7P50715 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Defa-rs7P50715 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Defa-rs7P50715 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Defa-rs7P50715 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Defa-rs7P50715 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Defa-rs7P50715 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Defa-rs7P50715 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Defa-rs7P50715 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Defa-rs7P50715 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Defa-rs7P50715 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Defa-rs7P50715 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Defa-rs7P50715 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Defa-rs7P50715 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Defa-rs7P50715 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms