Protein–RNA interactions for Protein: P50586

Tub, Tubby protein, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TubP50586 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TubP50586 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TubP50586 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TubP50586 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TubP50586 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TubP50586 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TubP50586 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TubP50586 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TubP50586 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TubP50586 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TubP50586 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TubP50586 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TubP50586 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TubP50586 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TubP50586 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TubP50586 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TubP50586 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TubP50586 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TubP50586 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TubP50586 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TubP50586 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TubP50586 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TubP50586 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TubP50586 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TubP50586 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TubP50586 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TubP50586 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TubP50586 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TubP50586 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TubP50586 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TubP50586 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TubP50586 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TubP50586 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TubP50586 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TubP50586 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TubP50586 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TubP50586 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TubP50586 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TubP50586 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TubP50586 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TubP50586 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TubP50586 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TubP50586 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TubP50586 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TubP50586 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TubP50586 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TubP50586 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TubP50586 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TubP50586 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TubP50586 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TubP50586 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TubP50586 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TubP50586 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TubP50586 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TubP50586 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TubP50586 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TubP50586 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TubP50586 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TubP50586 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TubP50586 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TubP50586 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TubP50586 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TubP50586 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TubP50586 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TubP50586 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TubP50586 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TubP50586 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TubP50586 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TubP50586 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TubP50586 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TubP50586 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TubP50586 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TubP50586 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TubP50586 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TubP50586 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TubP50586 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TubP50586 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TubP50586 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TubP50586 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TubP50586 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TubP50586 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TubP50586 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TubP50586 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TubP50586 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TubP50586 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TubP50586 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TubP50586 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TubP50586 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TubP50586 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TubP50586 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TubP50586 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TubP50586 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TubP50586 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TubP50586 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TubP50586 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TubP50586 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TubP50586 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TubP50586 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TubP50586 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TubP50586 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms