Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LtbrP50284 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LtbrP50284 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LtbrP50284 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LtbrP50284 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
LtbrP50284 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LtbrP50284 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LtbrP50284 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LtbrP50284 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LtbrP50284 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LtbrP50284 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LtbrP50284 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LtbrP50284 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LtbrP50284 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LtbrP50284 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LtbrP50284 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LtbrP50284 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LtbrP50284 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LtbrP50284 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LtbrP50284 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LtbrP50284 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LtbrP50284 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
LtbrP50284 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LtbrP50284 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LtbrP50284 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LtbrP50284 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LtbrP50284 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LtbrP50284 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LtbrP50284 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LtbrP50284 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LtbrP50284 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LtbrP50284 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LtbrP50284 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LtbrP50284 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LtbrP50284 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LtbrP50284 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LtbrP50284 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LtbrP50284 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LtbrP50284 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LtbrP50284 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LtbrP50284 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LtbrP50284 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LtbrP50284 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LtbrP50284 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LtbrP50284 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LtbrP50284 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LtbrP50284 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LtbrP50284 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LtbrP50284 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LtbrP50284 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LtbrP50284 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LtbrP50284 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
LtbrP50284 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LtbrP50284 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LtbrP50284 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LtbrP50284 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LtbrP50284 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LtbrP50284 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LtbrP50284 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LtbrP50284 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LtbrP50284 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LtbrP50284 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LtbrP50284 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LtbrP50284 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LtbrP50284 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LtbrP50284 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LtbrP50284 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LtbrP50284 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LtbrP50284 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LtbrP50284 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LtbrP50284 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LtbrP50284 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LtbrP50284 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LtbrP50284 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LtbrP50284 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LtbrP50284 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
LtbrP50284 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LtbrP50284 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LtbrP50284 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LtbrP50284 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LtbrP50284 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LtbrP50284 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LtbrP50284 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LtbrP50284 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LtbrP50284 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LtbrP50284 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LtbrP50284 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LtbrP50284 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LtbrP50284 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LtbrP50284 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LtbrP50284 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LtbrP50284 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LtbrP50284 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LtbrP50284 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LtbrP50284 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LtbrP50284 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LtbrP50284 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LtbrP50284 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LtbrP50284 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LtbrP50284 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms