Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cxcl5P50228 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cxcl5P50228 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cxcl5P50228 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cxcl5P50228 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cxcl5P50228 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cxcl5P50228 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cxcl5P50228 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cxcl5P50228 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cxcl5P50228 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cxcl5P50228 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cxcl5P50228 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cxcl5P50228 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cxcl5P50228 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cxcl5P50228 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cxcl5P50228 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cxcl5P50228 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cxcl5P50228 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cxcl5P50228 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cxcl5P50228 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cxcl5P50228 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cxcl5P50228 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cxcl5P50228 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cxcl5P50228 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cxcl5P50228 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cxcl5P50228 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cxcl5P50228 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cxcl5P50228 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cxcl5P50228 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cxcl5P50228 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cxcl5P50228 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cxcl5P50228 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cxcl5P50228 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cxcl5P50228 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cxcl5P50228 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cxcl5P50228 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cxcl5P50228 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cxcl5P50228 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cxcl5P50228 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cxcl5P50228 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cxcl5P50228 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cxcl5P50228 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cxcl5P50228 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cxcl5P50228 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cxcl5P50228 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cxcl5P50228 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cxcl5P50228 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cxcl5P50228 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cxcl5P50228 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cxcl5P50228 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cxcl5P50228 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cxcl5P50228 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cxcl5P50228 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cxcl5P50228 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cxcl5P50228 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cxcl5P50228 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cxcl5P50228 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cxcl5P50228 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cxcl5P50228 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cxcl5P50228 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cxcl5P50228 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cxcl5P50228 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cxcl5P50228 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cxcl5P50228 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cxcl5P50228 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cxcl5P50228 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cxcl5P50228 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cxcl5P50228 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cxcl5P50228 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cxcl5P50228 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cxcl5P50228 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cxcl5P50228 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cxcl5P50228 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cxcl5P50228 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cxcl5P50228 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cxcl5P50228 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cxcl5P50228 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cxcl5P50228 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cxcl5P50228 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cxcl5P50228 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cxcl5P50228 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cxcl5P50228 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cxcl5P50228 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cxcl5P50228 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cxcl5P50228 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cxcl5P50228 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cxcl5P50228 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cxcl5P50228 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cxcl5P50228 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cxcl5P50228 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cxcl5P50228 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cxcl5P50228 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cxcl5P50228 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cxcl5P50228 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cxcl5P50228 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cxcl5P50228 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cxcl5P50228 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cxcl5P50228 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cxcl5P50228 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cxcl5P50228 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms