Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24,58■■□□□ 1,53
Abcd1P48410 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,58■■□□□ 1,53
Abcd1P48410 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
Abcd1P48410 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
Abcd1P48410 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,52
Abcd1P48410 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,52
Abcd1P48410 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,52
Abcd1P48410 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,52
Abcd1P48410 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Abcd1P48410 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Abcd1P48410 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24,57■■□□□ 1,52
Abcd1P48410 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24,57■■□□□ 1,52
Abcd1P48410 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,57■■□□□ 1,52
Abcd1P48410 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Abcd1P48410 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Abcd1P48410 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Abcd1P48410 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,56■■□□□ 1,52
Abcd1P48410 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Abcd1P48410 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,56■■□□□ 1,52
Abcd1P48410 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Abcd1P48410 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24,55■■□□□ 1,52
Abcd1P48410 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,55■■□□□ 1,52
Abcd1P48410 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Abcd1P48410 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24,55■■□□□ 1,52
Abcd1P48410 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Abcd1P48410 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,55■■□□□ 1,52
Abcd1P48410 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Abcd1P48410 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24,54■■□□□ 1,52
Abcd1P48410 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24,54■■□□□ 1,52
Abcd1P48410 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Abcd1P48410 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Abcd1P48410 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Abcd1P48410 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24,53■■□□□ 1,52
Abcd1P48410 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24,53■■□□□ 1,52
Abcd1P48410 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24,53■■□□□ 1,52
Abcd1P48410 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Abcd1P48410 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Abcd1P48410 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Abcd1P48410 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Abcd1P48410 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Abcd1P48410 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Abcd1P48410 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Abcd1P48410 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Abcd1P48410 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Abcd1P48410 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Abcd1P48410 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Abcd1P48410 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,5■■□□□ 1,51
Abcd1P48410 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24,5■■□□□ 1,51
Abcd1P48410 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Abcd1P48410 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,5■■□□□ 1,51
Abcd1P48410 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Abcd1P48410 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24,5■■□□□ 1,51
Abcd1P48410 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Abcd1P48410 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Abcd1P48410 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,49■■□□□ 1,51
Abcd1P48410 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Abcd1P48410 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Abcd1P48410 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24,49■■□□□ 1,51
Abcd1P48410 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,48■■□□□ 1,51
Abcd1P48410 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,48■■□□□ 1,51
Abcd1P48410 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,48■■□□□ 1,51
Abcd1P48410 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Abcd1P48410 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Abcd1P48410 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24,47■■□□□ 1,51
Abcd1P48410 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Abcd1P48410 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Abcd1P48410 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Abcd1P48410 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Abcd1P48410 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24,46■■□□□ 1,51
Abcd1P48410 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,46■■□□□ 1,51
Abcd1P48410 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Abcd1P48410 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Abcd1P48410 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,45■■□□□ 1,51
Abcd1P48410 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,51
Abcd1P48410 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,45■■□□□ 1,5
Abcd1P48410 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
Abcd1P48410 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
Abcd1P48410 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,45■■□□□ 1,5
Abcd1P48410 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24,44■■□□□ 1,5
Abcd1P48410 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
Abcd1P48410 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
Abcd1P48410 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Abcd1P48410 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,43■■□□□ 1,5
Abcd1P48410 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24,43■■□□□ 1,5
Abcd1P48410 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Abcd1P48410 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Abcd1P48410 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Abcd1P48410 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Abcd1P48410 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24,42■■□□□ 1,5
Abcd1P48410 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Abcd1P48410 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Abcd1P48410 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
Abcd1P48410 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24,41■■□□□ 1,5
Abcd1P48410 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,4■■□□□ 1,5
Abcd1P48410 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Abcd1P48410 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,5
Abcd1P48410 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24,39■■□□□ 1,5
Abcd1P48410 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24,39■■□□□ 1,49
Abcd1P48410 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24,39■■□□□ 1,49
Abcd1P48410 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24,8 ms