Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SrprbP47758 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SrprbP47758 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SrprbP47758 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SrprbP47758 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SrprbP47758 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SrprbP47758 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SrprbP47758 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SrprbP47758 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SrprbP47758 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SrprbP47758 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SrprbP47758 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SrprbP47758 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SrprbP47758 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SrprbP47758 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SrprbP47758 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SrprbP47758 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SrprbP47758 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SrprbP47758 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SrprbP47758 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SrprbP47758 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SrprbP47758 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SrprbP47758 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SrprbP47758 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SrprbP47758 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SrprbP47758 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SrprbP47758 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SrprbP47758 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SrprbP47758 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SrprbP47758 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SrprbP47758 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SrprbP47758 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SrprbP47758 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SrprbP47758 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SrprbP47758 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SrprbP47758 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SrprbP47758 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SrprbP47758 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SrprbP47758 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SrprbP47758 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SrprbP47758 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SrprbP47758 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SrprbP47758 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SrprbP47758 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SrprbP47758 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SrprbP47758 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SrprbP47758 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SrprbP47758 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SrprbP47758 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SrprbP47758 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SrprbP47758 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SrprbP47758 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SrprbP47758 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SrprbP47758 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SrprbP47758 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SrprbP47758 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SrprbP47758 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SrprbP47758 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SrprbP47758 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SrprbP47758 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SrprbP47758 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SrprbP47758 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SrprbP47758 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SrprbP47758 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SrprbP47758 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SrprbP47758 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SrprbP47758 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SrprbP47758 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SrprbP47758 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SrprbP47758 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SrprbP47758 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SrprbP47758 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SrprbP47758 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SrprbP47758 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SrprbP47758 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SrprbP47758 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SrprbP47758 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SrprbP47758 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SrprbP47758 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SrprbP47758 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SrprbP47758 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SrprbP47758 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SrprbP47758 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SrprbP47758 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SrprbP47758 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SrprbP47758 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SrprbP47758 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SrprbP47758 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SrprbP47758 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SrprbP47758 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SrprbP47758 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SrprbP47758 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SrprbP47758 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SrprbP47758 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SrprbP47758 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SrprbP47758 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SrprbP47758 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SrprbP47758 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SrprbP47758 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SrprbP47758 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms