Protein–RNA interactions for Protein: P47708

Rph3a, Rabphilin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3aP47708 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rph3aP47708 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rph3aP47708 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rph3aP47708 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rph3aP47708 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rph3aP47708 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rph3aP47708 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rph3aP47708 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rph3aP47708 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rph3aP47708 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rph3aP47708 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rph3aP47708 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rph3aP47708 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rph3aP47708 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rph3aP47708 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rph3aP47708 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rph3aP47708 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rph3aP47708 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rph3aP47708 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rph3aP47708 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rph3aP47708 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rph3aP47708 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rph3aP47708 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rph3aP47708 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rph3aP47708 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rph3aP47708 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rph3aP47708 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rph3aP47708 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rph3aP47708 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rph3aP47708 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rph3aP47708 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rph3aP47708 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rph3aP47708 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rph3aP47708 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rph3aP47708 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rph3aP47708 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rph3aP47708 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rph3aP47708 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rph3aP47708 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rph3aP47708 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rph3aP47708 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rph3aP47708 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rph3aP47708 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rph3aP47708 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rph3aP47708 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rph3aP47708 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rph3aP47708 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rph3aP47708 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rph3aP47708 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rph3aP47708 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rph3aP47708 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rph3aP47708 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rph3aP47708 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rph3aP47708 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rph3aP47708 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rph3aP47708 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rph3aP47708 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rph3aP47708 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rph3aP47708 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rph3aP47708 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rph3aP47708 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rph3aP47708 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rph3aP47708 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rph3aP47708 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rph3aP47708 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rph3aP47708 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rph3aP47708 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rph3aP47708 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rph3aP47708 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rph3aP47708 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rph3aP47708 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rph3aP47708 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rph3aP47708 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rph3aP47708 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rph3aP47708 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rph3aP47708 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rph3aP47708 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rph3aP47708 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rph3aP47708 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rph3aP47708 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rph3aP47708 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rph3aP47708 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rph3aP47708 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rph3aP47708 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rph3aP47708 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rph3aP47708 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rph3aP47708 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rph3aP47708 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rph3aP47708 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rph3aP47708 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rph3aP47708 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rph3aP47708 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rph3aP47708 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rph3aP47708 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rph3aP47708 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rph3aP47708 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rph3aP47708 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rph3aP47708 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rph3aP47708 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rph3aP47708 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms