Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mmp9P41245 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Mmp9P41245 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mmp9P41245 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mmp9P41245 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mmp9P41245 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mmp9P41245 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mmp9P41245 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mmp9P41245 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Mmp9P41245 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp9P41245 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp9P41245 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp9P41245 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp9P41245 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp9P41245 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp9P41245 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp9P41245 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp9P41245 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mmp9P41245 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mmp9P41245 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mmp9P41245 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mmp9P41245 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Mmp9P41245 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Mmp9P41245 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mmp9P41245 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mmp9P41245 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mmp9P41245 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mmp9P41245 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mmp9P41245 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mmp9P41245 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mmp9P41245 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mmp9P41245 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mmp9P41245 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mmp9P41245 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mmp9P41245 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mmp9P41245 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mmp9P41245 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mmp9P41245 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Mmp9P41245 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp9P41245 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp9P41245 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp9P41245 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp9P41245 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp9P41245 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Mmp9P41245 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Mmp9P41245 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mmp9P41245 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mmp9P41245 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mmp9P41245 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mmp9P41245 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mmp9P41245 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mmp9P41245 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mmp9P41245 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mmp9P41245 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mmp9P41245 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mmp9P41245 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mmp9P41245 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mmp9P41245 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mmp9P41245 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mmp9P41245 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mmp9P41245 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mmp9P41245 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mmp9P41245 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mmp9P41245 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mmp9P41245 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mmp9P41245 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mmp9P41245 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mmp9P41245 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mmp9P41245 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mmp9P41245 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mmp9P41245 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mmp9P41245 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mmp9P41245 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mmp9P41245 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mmp9P41245 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp9P41245 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp9P41245 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp9P41245 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp9P41245 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp9P41245 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp9P41245 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp9P41245 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp9P41245 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp9P41245 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp9P41245 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp9P41245 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp9P41245 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp9P41245 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp9P41245 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp9P41245 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp9P41245 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp9P41245 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mmp9P41245 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mmp9P41245 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Mmp9P41245 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mmp9P41245 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp9P41245 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp9P41245 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp9P41245 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp9P41245 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms