Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TtlP38585 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TtlP38585 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TtlP38585 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TtlP38585 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TtlP38585 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TtlP38585 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TtlP38585 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TtlP38585 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TtlP38585 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TtlP38585 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TtlP38585 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TtlP38585 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TtlP38585 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TtlP38585 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TtlP38585 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TtlP38585 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TtlP38585 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TtlP38585 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TtlP38585 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TtlP38585 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TtlP38585 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TtlP38585 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TtlP38585 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TtlP38585 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TtlP38585 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TtlP38585 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TtlP38585 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TtlP38585 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TtlP38585 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TtlP38585 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TtlP38585 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TtlP38585 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TtlP38585 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TtlP38585 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TtlP38585 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TtlP38585 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TtlP38585 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TtlP38585 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TtlP38585 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TtlP38585 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TtlP38585 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TtlP38585 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TtlP38585 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TtlP38585 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TtlP38585 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TtlP38585 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TtlP38585 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TtlP38585 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TtlP38585 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TtlP38585 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TtlP38585 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TtlP38585 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TtlP38585 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TtlP38585 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TtlP38585 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TtlP38585 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TtlP38585 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TtlP38585 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TtlP38585 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TtlP38585 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TtlP38585 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TtlP38585 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TtlP38585 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TtlP38585 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TtlP38585 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TtlP38585 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TtlP38585 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TtlP38585 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TtlP38585 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TtlP38585 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TtlP38585 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TtlP38585 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TtlP38585 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TtlP38585 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TtlP38585 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TtlP38585 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TtlP38585 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TtlP38585 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TtlP38585 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TtlP38585 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TtlP38585 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TtlP38585 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TtlP38585 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TtlP38585 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TtlP38585 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TtlP38585 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TtlP38585 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TtlP38585 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TtlP38585 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TtlP38585 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TtlP38585 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TtlP38585 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TtlP38585 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TtlP38585 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TtlP38585 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TtlP38585 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TtlP38585 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TtlP38585 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TtlP38585 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms