Protein–RNA interactions for Protein: P38060

Hmgcl, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgclP38060 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HmgclP38060 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HmgclP38060 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HmgclP38060 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HmgclP38060 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HmgclP38060 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HmgclP38060 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HmgclP38060 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HmgclP38060 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HmgclP38060 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HmgclP38060 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HmgclP38060 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HmgclP38060 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HmgclP38060 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HmgclP38060 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HmgclP38060 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HmgclP38060 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HmgclP38060 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HmgclP38060 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HmgclP38060 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HmgclP38060 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HmgclP38060 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HmgclP38060 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HmgclP38060 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HmgclP38060 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HmgclP38060 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HmgclP38060 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HmgclP38060 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HmgclP38060 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HmgclP38060 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HmgclP38060 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HmgclP38060 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HmgclP38060 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HmgclP38060 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HmgclP38060 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HmgclP38060 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HmgclP38060 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HmgclP38060 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HmgclP38060 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HmgclP38060 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HmgclP38060 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HmgclP38060 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HmgclP38060 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HmgclP38060 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HmgclP38060 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HmgclP38060 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HmgclP38060 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HmgclP38060 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HmgclP38060 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HmgclP38060 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HmgclP38060 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HmgclP38060 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HmgclP38060 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HmgclP38060 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HmgclP38060 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HmgclP38060 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HmgclP38060 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HmgclP38060 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HmgclP38060 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HmgclP38060 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HmgclP38060 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HmgclP38060 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HmgclP38060 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HmgclP38060 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HmgclP38060 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HmgclP38060 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HmgclP38060 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HmgclP38060 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HmgclP38060 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HmgclP38060 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HmgclP38060 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HmgclP38060 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HmgclP38060 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HmgclP38060 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HmgclP38060 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HmgclP38060 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HmgclP38060 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HmgclP38060 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HmgclP38060 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HmgclP38060 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HmgclP38060 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HmgclP38060 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HmgclP38060 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HmgclP38060 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HmgclP38060 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HmgclP38060 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HmgclP38060 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HmgclP38060 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HmgclP38060 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HmgclP38060 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HmgclP38060 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HmgclP38060 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HmgclP38060 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HmgclP38060 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HmgclP38060 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HmgclP38060 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HmgclP38060 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HmgclP38060 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HmgclP38060 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HmgclP38060 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms