Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PpargP37238 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PpargP37238 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PpargP37238 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PpargP37238 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PpargP37238 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PpargP37238 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PpargP37238 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PpargP37238 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PpargP37238 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PpargP37238 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PpargP37238 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PpargP37238 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PpargP37238 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PpargP37238 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PpargP37238 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PpargP37238 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PpargP37238 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PpargP37238 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PpargP37238 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PpargP37238 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PpargP37238 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PpargP37238 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PpargP37238 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PpargP37238 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PpargP37238 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PpargP37238 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PpargP37238 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PpargP37238 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PpargP37238 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PpargP37238 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PpargP37238 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PpargP37238 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PpargP37238 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PpargP37238 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PpargP37238 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PpargP37238 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PpargP37238 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PpargP37238 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PpargP37238 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PpargP37238 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PpargP37238 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PpargP37238 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PpargP37238 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PpargP37238 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PpargP37238 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PpargP37238 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PpargP37238 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PpargP37238 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PpargP37238 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PpargP37238 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PpargP37238 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PpargP37238 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PpargP37238 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PpargP37238 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PpargP37238 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PpargP37238 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PpargP37238 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PpargP37238 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PpargP37238 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PpargP37238 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PpargP37238 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PpargP37238 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PpargP37238 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PpargP37238 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PpargP37238 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PpargP37238 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PpargP37238 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PpargP37238 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PpargP37238 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PpargP37238 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PpargP37238 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PpargP37238 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PpargP37238 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PpargP37238 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PpargP37238 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PpargP37238 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PpargP37238 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PpargP37238 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PpargP37238 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PpargP37238 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PpargP37238 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PpargP37238 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PpargP37238 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PpargP37238 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PpargP37238 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PpargP37238 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PpargP37238 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PpargP37238 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PpargP37238 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PpargP37238 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PpargP37238 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PpargP37238 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PpargP37238 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PpargP37238 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PpargP37238 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PpargP37238 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PpargP37238 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PpargP37238 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PpargP37238 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms