Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab17P35292 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab17P35292 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab17P35292 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab17P35292 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab17P35292 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab17P35292 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab17P35292 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab17P35292 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab17P35292 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab17P35292 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab17P35292 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab17P35292 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab17P35292 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab17P35292 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab17P35292 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab17P35292 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab17P35292 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab17P35292 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab17P35292 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rab17P35292 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rab17P35292 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rab17P35292 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rab17P35292 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab17P35292 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab17P35292 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab17P35292 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab17P35292 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab17P35292 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab17P35292 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab17P35292 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab17P35292 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab17P35292 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab17P35292 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab17P35292 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab17P35292 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab17P35292 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab17P35292 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab17P35292 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab17P35292 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab17P35292 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab17P35292 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab17P35292 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab17P35292 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab17P35292 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab17P35292 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab17P35292 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rab17P35292 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rab17P35292 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rab17P35292 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rab17P35292 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab17P35292 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab17P35292 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab17P35292 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab17P35292 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab17P35292 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab17P35292 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab17P35292 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab17P35292 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab17P35292 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab17P35292 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab17P35292 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab17P35292 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab17P35292 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab17P35292 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab17P35292 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab17P35292 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab17P35292 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab17P35292 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab17P35292 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab17P35292 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab17P35292 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab17P35292 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab17P35292 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab17P35292 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rab17P35292 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rab17P35292 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rab17P35292 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Rab17P35292 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab17P35292 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab17P35292 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab17P35292 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rab17P35292 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab17P35292 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab17P35292 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab17P35292 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab17P35292 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab17P35292 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab17P35292 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab17P35292 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rab17P35292 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab17P35292 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab17P35292 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab17P35292 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab17P35292 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab17P35292 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rab17P35292 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rab17P35292 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rab17P35292 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rab17P35292 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms