Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tfap2aP34056 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tfap2aP34056 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tfap2aP34056 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tfap2aP34056 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tfap2aP34056 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tfap2aP34056 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tfap2aP34056 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tfap2aP34056 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tfap2aP34056 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tfap2aP34056 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tfap2aP34056 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tfap2aP34056 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tfap2aP34056 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tfap2aP34056 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tfap2aP34056 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tfap2aP34056 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tfap2aP34056 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tfap2aP34056 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tfap2aP34056 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tfap2aP34056 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tfap2aP34056 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tfap2aP34056 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tfap2aP34056 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tfap2aP34056 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tfap2aP34056 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tfap2aP34056 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tfap2aP34056 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tfap2aP34056 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tfap2aP34056 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tfap2aP34056 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tfap2aP34056 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tfap2aP34056 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tfap2aP34056 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tfap2aP34056 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tfap2aP34056 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tfap2aP34056 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tfap2aP34056 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tfap2aP34056 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tfap2aP34056 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tfap2aP34056 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tfap2aP34056 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tfap2aP34056 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tfap2aP34056 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tfap2aP34056 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tfap2aP34056 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tfap2aP34056 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tfap2aP34056 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tfap2aP34056 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tfap2aP34056 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tfap2aP34056 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tfap2aP34056 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tfap2aP34056 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tfap2aP34056 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Tfap2aP34056 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tfap2aP34056 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tfap2aP34056 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tfap2aP34056 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tfap2aP34056 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tfap2aP34056 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tfap2aP34056 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tfap2aP34056 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tfap2aP34056 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tfap2aP34056 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tfap2aP34056 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tfap2aP34056 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tfap2aP34056 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tfap2aP34056 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tfap2aP34056 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tfap2aP34056 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tfap2aP34056 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tfap2aP34056 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tfap2aP34056 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tfap2aP34056 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tfap2aP34056 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tfap2aP34056 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tfap2aP34056 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tfap2aP34056 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tfap2aP34056 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tfap2aP34056 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tfap2aP34056 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tfap2aP34056 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tfap2aP34056 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tfap2aP34056 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tfap2aP34056 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tfap2aP34056 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tfap2aP34056 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tfap2aP34056 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tfap2aP34056 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tfap2aP34056 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tfap2aP34056 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tfap2aP34056 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tfap2aP34056 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tfap2aP34056 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tfap2aP34056 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tfap2aP34056 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tfap2aP34056 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tfap2aP34056 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tfap2aP34056 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tfap2aP34056 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms