Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hoxc10P31257 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hoxc10P31257 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hoxc10P31257 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hoxc10P31257 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hoxc10P31257 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Hoxc10P31257 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hoxc10P31257 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hoxc10P31257 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hoxc10P31257 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hoxc10P31257 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hoxc10P31257 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Hoxc10P31257 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hoxc10P31257 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hoxc10P31257 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hoxc10P31257 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hoxc10P31257 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hoxc10P31257 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hoxc10P31257 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hoxc10P31257 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hoxc10P31257 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hoxc10P31257 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hoxc10P31257 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hoxc10P31257 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hoxc10P31257 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hoxc10P31257 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hoxc10P31257 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hoxc10P31257 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hoxc10P31257 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hoxc10P31257 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Hoxc10P31257 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hoxc10P31257 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hoxc10P31257 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hoxc10P31257 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hoxc10P31257 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hoxc10P31257 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hoxc10P31257 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Hoxc10P31257 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hoxc10P31257 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Hoxc10P31257 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hoxc10P31257 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hoxc10P31257 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hoxc10P31257 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hoxc10P31257 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxc10P31257 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxc10P31257 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxc10P31257 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxc10P31257 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxc10P31257 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxc10P31257 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxc10P31257 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxc10P31257 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hoxc10P31257 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hoxc10P31257 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hoxc10P31257 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hoxc10P31257 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxc10P31257 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxc10P31257 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxc10P31257 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxc10P31257 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxc10P31257 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxc10P31257 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxc10P31257 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxc10P31257 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxc10P31257 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Hoxc10P31257 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Hoxc10P31257 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Hoxc10P31257 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hoxc10P31257 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hoxc10P31257 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hoxc10P31257 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hoxc10P31257 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hoxc10P31257 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hoxc10P31257 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hoxc10P31257 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hoxc10P31257 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hoxc10P31257 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxc10P31257 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxc10P31257 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxc10P31257 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxc10P31257 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxc10P31257 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxc10P31257 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxc10P31257 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxc10P31257 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxc10P31257 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxc10P31257 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxc10P31257 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxc10P31257 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxc10P31257 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxc10P31257 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxc10P31257 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxc10P31257 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxc10P31257 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxc10P31257 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxc10P31257 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxc10P31257 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxc10P31257 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxc10P31257 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxc10P31257 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms