Protein–RNA interactions for Protein: P31001

Des, Desmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DesP31001 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DesP31001 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DesP31001 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DesP31001 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DesP31001 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DesP31001 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DesP31001 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DesP31001 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DesP31001 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DesP31001 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DesP31001 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DesP31001 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DesP31001 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DesP31001 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DesP31001 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DesP31001 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DesP31001 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DesP31001 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DesP31001 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DesP31001 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DesP31001 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DesP31001 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DesP31001 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DesP31001 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DesP31001 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DesP31001 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DesP31001 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DesP31001 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DesP31001 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DesP31001 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DesP31001 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DesP31001 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DesP31001 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DesP31001 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DesP31001 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DesP31001 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DesP31001 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DesP31001 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DesP31001 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DesP31001 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DesP31001 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DesP31001 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DesP31001 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DesP31001 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DesP31001 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DesP31001 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
DesP31001 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DesP31001 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DesP31001 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DesP31001 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DesP31001 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DesP31001 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DesP31001 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DesP31001 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DesP31001 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DesP31001 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DesP31001 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DesP31001 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DesP31001 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DesP31001 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DesP31001 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DesP31001 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DesP31001 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DesP31001 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DesP31001 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DesP31001 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DesP31001 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DesP31001 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DesP31001 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DesP31001 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DesP31001 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DesP31001 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DesP31001 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DesP31001 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DesP31001 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DesP31001 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DesP31001 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DesP31001 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DesP31001 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DesP31001 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DesP31001 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DesP31001 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DesP31001 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DesP31001 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DesP31001 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DesP31001 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DesP31001 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DesP31001 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DesP31001 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DesP31001 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DesP31001 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DesP31001 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DesP31001 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DesP31001 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DesP31001 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DesP31001 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DesP31001 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DesP31001 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DesP31001 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DesP31001 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms