Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RxrbP28704 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RxrbP28704 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RxrbP28704 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RxrbP28704 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RxrbP28704 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RxrbP28704 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RxrbP28704 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RxrbP28704 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RxrbP28704 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RxrbP28704 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RxrbP28704 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RxrbP28704 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RxrbP28704 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RxrbP28704 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RxrbP28704 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RxrbP28704 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RxrbP28704 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RxrbP28704 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RxrbP28704 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RxrbP28704 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RxrbP28704 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RxrbP28704 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RxrbP28704 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RxrbP28704 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RxrbP28704 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RxrbP28704 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RxrbP28704 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RxrbP28704 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RxrbP28704 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RxrbP28704 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RxrbP28704 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RxrbP28704 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RxrbP28704 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RxrbP28704 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RxrbP28704 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RxrbP28704 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RxrbP28704 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RxrbP28704 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RxrbP28704 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RxrbP28704 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RxrbP28704 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RxrbP28704 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RxrbP28704 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RxrbP28704 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RxrbP28704 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RxrbP28704 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RxrbP28704 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RxrbP28704 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RxrbP28704 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RxrbP28704 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RxrbP28704 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RxrbP28704 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RxrbP28704 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RxrbP28704 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RxrbP28704 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RxrbP28704 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RxrbP28704 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RxrbP28704 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RxrbP28704 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RxrbP28704 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RxrbP28704 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RxrbP28704 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RxrbP28704 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RxrbP28704 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RxrbP28704 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RxrbP28704 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RxrbP28704 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RxrbP28704 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RxrbP28704 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RxrbP28704 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RxrbP28704 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RxrbP28704 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RxrbP28704 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RxrbP28704 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RxrbP28704 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RxrbP28704 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RxrbP28704 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RxrbP28704 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RxrbP28704 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RxrbP28704 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RxrbP28704 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RxrbP28704 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RxrbP28704 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RxrbP28704 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RxrbP28704 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RxrbP28704 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RxrbP28704 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RxrbP28704 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RxrbP28704 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RxrbP28704 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RxrbP28704 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RxrbP28704 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RxrbP28704 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RxrbP28704 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RxrbP28704 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RxrbP28704 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RxrbP28704 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RxrbP28704 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RxrbP28704 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms