Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gja4P28235 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gja4P28235 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gja4P28235 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gja4P28235 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gja4P28235 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gja4P28235 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gja4P28235 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gja4P28235 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gja4P28235 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gja4P28235 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gja4P28235 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gja4P28235 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gja4P28235 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gja4P28235 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gja4P28235 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gja4P28235 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gja4P28235 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gja4P28235 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gja4P28235 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gja4P28235 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gja4P28235 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gja4P28235 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gja4P28235 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gja4P28235 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gja4P28235 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gja4P28235 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gja4P28235 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gja4P28235 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gja4P28235 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gja4P28235 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gja4P28235 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gja4P28235 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gja4P28235 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gja4P28235 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gja4P28235 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gja4P28235 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gja4P28235 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gja4P28235 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gja4P28235 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gja4P28235 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gja4P28235 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gja4P28235 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gja4P28235 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gja4P28235 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gja4P28235 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gja4P28235 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gja4P28235 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gja4P28235 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gja4P28235 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gja4P28235 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gja4P28235 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gja4P28235 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gja4P28235 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gja4P28235 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gja4P28235 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gja4P28235 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gja4P28235 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gja4P28235 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gja4P28235 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gja4P28235 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gja4P28235 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja4P28235 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja4P28235 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja4P28235 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja4P28235 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja4P28235 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja4P28235 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja4P28235 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja4P28235 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gja4P28235 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gja4P28235 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gja4P28235 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gja4P28235 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gja4P28235 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gja4P28235 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gja4P28235 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gja4P28235 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gja4P28235 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gja4P28235 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gja4P28235 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gja4P28235 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gja4P28235 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gja4P28235 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gja4P28235 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gja4P28235 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gja4P28235 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gja4P28235 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gja4P28235 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gja4P28235 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gja4P28235 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gja4P28235 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gja4P28235 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gja4P28235 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gja4P28235 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gja4P28235 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gja4P28235 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gja4P28235 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gja4P28235 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gja4P28235 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms