Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
U2af2P26369 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
U2af2P26369 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
U2af2P26369 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
U2af2P26369 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
U2af2P26369 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
U2af2P26369 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
U2af2P26369 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
U2af2P26369 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
U2af2P26369 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
U2af2P26369 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
U2af2P26369 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
U2af2P26369 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
U2af2P26369 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
U2af2P26369 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
U2af2P26369 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
U2af2P26369 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
U2af2P26369 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
U2af2P26369 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
U2af2P26369 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
U2af2P26369 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
U2af2P26369 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
U2af2P26369 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
U2af2P26369 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
U2af2P26369 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
U2af2P26369 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
U2af2P26369 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
U2af2P26369 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
U2af2P26369 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
U2af2P26369 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
U2af2P26369 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
U2af2P26369 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
U2af2P26369 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
U2af2P26369 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
U2af2P26369 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
U2af2P26369 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
U2af2P26369 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
U2af2P26369 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
U2af2P26369 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
U2af2P26369 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
U2af2P26369 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
U2af2P26369 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
U2af2P26369 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
U2af2P26369 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
U2af2P26369 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
U2af2P26369 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
U2af2P26369 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
U2af2P26369 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
U2af2P26369 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
U2af2P26369 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
U2af2P26369 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
U2af2P26369 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
U2af2P26369 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
U2af2P26369 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
U2af2P26369 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
U2af2P26369 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
U2af2P26369 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
U2af2P26369 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
U2af2P26369 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
U2af2P26369 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
U2af2P26369 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
U2af2P26369 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
U2af2P26369 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2af2P26369 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2af2P26369 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2af2P26369 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
U2af2P26369 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2af2P26369 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2af2P26369 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2af2P26369 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2af2P26369 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
U2af2P26369 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
U2af2P26369 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
U2af2P26369 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
U2af2P26369 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
U2af2P26369 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
U2af2P26369 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
U2af2P26369 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
U2af2P26369 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
U2af2P26369 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
U2af2P26369 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
U2af2P26369 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2af2P26369 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2af2P26369 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2af2P26369 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2af2P26369 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2af2P26369 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2af2P26369 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2af2P26369 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
U2af2P26369 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
U2af2P26369 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
U2af2P26369 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
U2af2P26369 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
U2af2P26369 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
U2af2P26369 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
U2af2P26369 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
U2af2P26369 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
U2af2P26369 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
U2af2P26369 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2af2P26369 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms