Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
CftrP26361 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
CftrP26361 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
CftrP26361 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
CftrP26361 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
CftrP26361 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
CftrP26361 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
CftrP26361 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
CftrP26361 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
CftrP26361 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
CftrP26361 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
CftrP26361 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
CftrP26361 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
CftrP26361 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
CftrP26361 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
CftrP26361 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
CftrP26361 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
CftrP26361 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
CftrP26361 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
CftrP26361 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
CftrP26361 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
CftrP26361 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
CftrP26361 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
CftrP26361 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
CftrP26361 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
CftrP26361 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
CftrP26361 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC39.26■■■■□ 3.88
CftrP26361 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
CftrP26361 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
CftrP26361 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
CftrP26361 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
CftrP26361 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
CftrP26361 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
CftrP26361 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC39.24■■■■□ 3.87
CftrP26361 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
CftrP26361 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
CftrP26361 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
CftrP26361 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
CftrP26361 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
CftrP26361 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
CftrP26361 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
CftrP26361 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
CftrP26361 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
CftrP26361 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
CftrP26361 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC39.21■■■■□ 3.87
CftrP26361 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
CftrP26361 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
CftrP26361 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
CftrP26361 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC39.18■■■■□ 3.86
CftrP26361 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
CftrP26361 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
CftrP26361 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
CftrP26361 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
CftrP26361 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
CftrP26361 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
CftrP26361 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
CftrP26361 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
CftrP26361 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC39.15■■■■□ 3.86
CftrP26361 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
CftrP26361 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
CftrP26361 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
CftrP26361 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
CftrP26361 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
CftrP26361 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC39.11■■■■□ 3.85
CftrP26361 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
CftrP26361 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
CftrP26361 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC39.1■■■■□ 3.85
CftrP26361 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
CftrP26361 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
CftrP26361 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
CftrP26361 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
CftrP26361 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
CftrP26361 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
CftrP26361 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC39.08■■■■□ 3.85
CftrP26361 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
CftrP26361 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC39.07■■■■□ 3.85
CftrP26361 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.85
CftrP26361 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
CftrP26361 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
CftrP26361 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
CftrP26361 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
CftrP26361 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
CftrP26361 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
CftrP26361 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
CftrP26361 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
CftrP26361 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
CftrP26361 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.04■■■■□ 3.84
CftrP26361 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
CftrP26361 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC39.04■■■■□ 3.84
CftrP26361 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
CftrP26361 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
CftrP26361 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
CftrP26361 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
CftrP26361 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
CftrP26361 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
CftrP26361 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC39.01■■■■□ 3.84
CftrP26361 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
CftrP26361 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.83
CftrP26361 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
CftrP26361 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 586.6 ms