Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ChgaP26339 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ChgaP26339 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ChgaP26339 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ChgaP26339 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ChgaP26339 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ChgaP26339 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ChgaP26339 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ChgaP26339 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ChgaP26339 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ChgaP26339 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ChgaP26339 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ChgaP26339 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ChgaP26339 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ChgaP26339 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ChgaP26339 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ChgaP26339 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ChgaP26339 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ChgaP26339 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ChgaP26339 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ChgaP26339 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ChgaP26339 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ChgaP26339 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ChgaP26339 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ChgaP26339 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ChgaP26339 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ChgaP26339 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ChgaP26339 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ChgaP26339 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ChgaP26339 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ChgaP26339 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ChgaP26339 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ChgaP26339 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ChgaP26339 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ChgaP26339 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ChgaP26339 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ChgaP26339 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ChgaP26339 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ChgaP26339 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ChgaP26339 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ChgaP26339 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ChgaP26339 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ChgaP26339 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ChgaP26339 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ChgaP26339 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ChgaP26339 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ChgaP26339 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ChgaP26339 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ChgaP26339 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ChgaP26339 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ChgaP26339 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ChgaP26339 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ChgaP26339 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ChgaP26339 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ChgaP26339 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ChgaP26339 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ChgaP26339 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ChgaP26339 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ChgaP26339 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ChgaP26339 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ChgaP26339 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ChgaP26339 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ChgaP26339 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ChgaP26339 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ChgaP26339 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ChgaP26339 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ChgaP26339 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ChgaP26339 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ChgaP26339 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ChgaP26339 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ChgaP26339 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ChgaP26339 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ChgaP26339 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ChgaP26339 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ChgaP26339 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ChgaP26339 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ChgaP26339 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ChgaP26339 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ChgaP26339 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ChgaP26339 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ChgaP26339 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ChgaP26339 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ChgaP26339 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ChgaP26339 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ChgaP26339 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ChgaP26339 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ChgaP26339 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ChgaP26339 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ChgaP26339 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ChgaP26339 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ChgaP26339 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ChgaP26339 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ChgaP26339 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ChgaP26339 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ChgaP26339 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ChgaP26339 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ChgaP26339 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ChgaP26339 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ChgaP26339 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ChgaP26339 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms