Protein–RNA interactions for Protein: P26048

Gabra2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra2P26048 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gabra2P26048 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gabra2P26048 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gabra2P26048 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gabra2P26048 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gabra2P26048 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gabra2P26048 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gabra2P26048 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gabra2P26048 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gabra2P26048 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gabra2P26048 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gabra2P26048 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gabra2P26048 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gabra2P26048 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gabra2P26048 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gabra2P26048 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gabra2P26048 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gabra2P26048 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gabra2P26048 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gabra2P26048 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gabra2P26048 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gabra2P26048 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gabra2P26048 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gabra2P26048 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gabra2P26048 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gabra2P26048 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gabra2P26048 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gabra2P26048 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gabra2P26048 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gabra2P26048 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gabra2P26048 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabra2P26048 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabra2P26048 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabra2P26048 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabra2P26048 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabra2P26048 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabra2P26048 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabra2P26048 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabra2P26048 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabra2P26048 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabra2P26048 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabra2P26048 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabra2P26048 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabra2P26048 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabra2P26048 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabra2P26048 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabra2P26048 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabra2P26048 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabra2P26048 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabra2P26048 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabra2P26048 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabra2P26048 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabra2P26048 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabra2P26048 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabra2P26048 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabra2P26048 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabra2P26048 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabra2P26048 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabra2P26048 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gabra2P26048 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gabra2P26048 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gabra2P26048 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gabra2P26048 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gabra2P26048 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gabra2P26048 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Gabra2P26048 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gabra2P26048 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gabra2P26048 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gabra2P26048 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gabra2P26048 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gabra2P26048 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gabra2P26048 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gabra2P26048 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gabra2P26048 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gabra2P26048 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gabra2P26048 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gabra2P26048 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gabra2P26048 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gabra2P26048 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gabra2P26048 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gabra2P26048 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gabra2P26048 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gabra2P26048 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gabra2P26048 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gabra2P26048 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gabra2P26048 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gabra2P26048 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Gabra2P26048 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gabra2P26048 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Gabra2P26048 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gabra2P26048 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gabra2P26048 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gabra2P26048 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gabra2P26048 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gabra2P26048 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gabra2P26048 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gabra2P26048 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gabra2P26048 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gabra2P26048 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gabra2P26048 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms