Protein–RNA interactions for Protein: P24549

Aldh1a1, Retinal dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a1P24549 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Aldh1a1P24549 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Aldh1a1P24549 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Aldh1a1P24549 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Aldh1a1P24549 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Aldh1a1P24549 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Aldh1a1P24549 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Aldh1a1P24549 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Aldh1a1P24549 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Aldh1a1P24549 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Aldh1a1P24549 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Aldh1a1P24549 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Aldh1a1P24549 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Aldh1a1P24549 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Aldh1a1P24549 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Aldh1a1P24549 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Aldh1a1P24549 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Aldh1a1P24549 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Aldh1a1P24549 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Aldh1a1P24549 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Aldh1a1P24549 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Aldh1a1P24549 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Aldh1a1P24549 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Aldh1a1P24549 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Aldh1a1P24549 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Aldh1a1P24549 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Aldh1a1P24549 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Aldh1a1P24549 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Aldh1a1P24549 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Aldh1a1P24549 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Aldh1a1P24549 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Aldh1a1P24549 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Aldh1a1P24549 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Aldh1a1P24549 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Aldh1a1P24549 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Aldh1a1P24549 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Aldh1a1P24549 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Aldh1a1P24549 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Aldh1a1P24549 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Aldh1a1P24549 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Aldh1a1P24549 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Aldh1a1P24549 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Aldh1a1P24549 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Aldh1a1P24549 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Aldh1a1P24549 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Aldh1a1P24549 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Aldh1a1P24549 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Aldh1a1P24549 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Aldh1a1P24549 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Aldh1a1P24549 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Aldh1a1P24549 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Aldh1a1P24549 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Aldh1a1P24549 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Aldh1a1P24549 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Aldh1a1P24549 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Aldh1a1P24549 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Aldh1a1P24549 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Aldh1a1P24549 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Aldh1a1P24549 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Aldh1a1P24549 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Aldh1a1P24549 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Aldh1a1P24549 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Aldh1a1P24549 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Aldh1a1P24549 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Aldh1a1P24549 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Aldh1a1P24549 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Aldh1a1P24549 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Aldh1a1P24549 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Aldh1a1P24549 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Aldh1a1P24549 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Aldh1a1P24549 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Aldh1a1P24549 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Aldh1a1P24549 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Aldh1a1P24549 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Aldh1a1P24549 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Aldh1a1P24549 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Aldh1a1P24549 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Aldh1a1P24549 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Aldh1a1P24549 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Aldh1a1P24549 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Aldh1a1P24549 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Aldh1a1P24549 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Aldh1a1P24549 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Aldh1a1P24549 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Aldh1a1P24549 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Aldh1a1P24549 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Aldh1a1P24549 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Aldh1a1P24549 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Aldh1a1P24549 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Aldh1a1P24549 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Aldh1a1P24549 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Aldh1a1P24549 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Aldh1a1P24549 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Aldh1a1P24549 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Aldh1a1P24549 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Aldh1a1P24549 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Aldh1a1P24549 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Aldh1a1P24549 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Aldh1a1P24549 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Aldh1a1P24549 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms