Protein–RNA interactions for Protein: P23738

Hdc, Histidine decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HdcP23738 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HdcP23738 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HdcP23738 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HdcP23738 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HdcP23738 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HdcP23738 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HdcP23738 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HdcP23738 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HdcP23738 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HdcP23738 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HdcP23738 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HdcP23738 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HdcP23738 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HdcP23738 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HdcP23738 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HdcP23738 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HdcP23738 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HdcP23738 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HdcP23738 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HdcP23738 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HdcP23738 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HdcP23738 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HdcP23738 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HdcP23738 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HdcP23738 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HdcP23738 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HdcP23738 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HdcP23738 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HdcP23738 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HdcP23738 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HdcP23738 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HdcP23738 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HdcP23738 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HdcP23738 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HdcP23738 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HdcP23738 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HdcP23738 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HdcP23738 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HdcP23738 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HdcP23738 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HdcP23738 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HdcP23738 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HdcP23738 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HdcP23738 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HdcP23738 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HdcP23738 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HdcP23738 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HdcP23738 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HdcP23738 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HdcP23738 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HdcP23738 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HdcP23738 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HdcP23738 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HdcP23738 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HdcP23738 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HdcP23738 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HdcP23738 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HdcP23738 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HdcP23738 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HdcP23738 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HdcP23738 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HdcP23738 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HdcP23738 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HdcP23738 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HdcP23738 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HdcP23738 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HdcP23738 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HdcP23738 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HdcP23738 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HdcP23738 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HdcP23738 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HdcP23738 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HdcP23738 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HdcP23738 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HdcP23738 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HdcP23738 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HdcP23738 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HdcP23738 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HdcP23738 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HdcP23738 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HdcP23738 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HdcP23738 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HdcP23738 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HdcP23738 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HdcP23738 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HdcP23738 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HdcP23738 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HdcP23738 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HdcP23738 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HdcP23738 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HdcP23738 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HdcP23738 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HdcP23738 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HdcP23738 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HdcP23738 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HdcP23738 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HdcP23738 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HdcP23738 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HdcP23738 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HdcP23738 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms