Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ggta1P23336 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ggta1P23336 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ggta1P23336 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ggta1P23336 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ggta1P23336 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ggta1P23336 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ggta1P23336 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ggta1P23336 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ggta1P23336 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ggta1P23336 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ggta1P23336 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ggta1P23336 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ggta1P23336 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ggta1P23336 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ggta1P23336 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ggta1P23336 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ggta1P23336 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ggta1P23336 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ggta1P23336 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ggta1P23336 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ggta1P23336 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ggta1P23336 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ggta1P23336 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ggta1P23336 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ggta1P23336 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ggta1P23336 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ggta1P23336 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ggta1P23336 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ggta1P23336 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ggta1P23336 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ggta1P23336 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ggta1P23336 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ggta1P23336 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ggta1P23336 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ggta1P23336 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ggta1P23336 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ggta1P23336 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ggta1P23336 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ggta1P23336 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ggta1P23336 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ggta1P23336 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ggta1P23336 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ggta1P23336 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ggta1P23336 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ggta1P23336 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ggta1P23336 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ggta1P23336 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ggta1P23336 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ggta1P23336 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ggta1P23336 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ggta1P23336 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ggta1P23336 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Ggta1P23336 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ggta1P23336 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ggta1P23336 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ggta1P23336 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ggta1P23336 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ggta1P23336 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ggta1P23336 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ggta1P23336 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ggta1P23336 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ggta1P23336 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ggta1P23336 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ggta1P23336 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ggta1P23336 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ggta1P23336 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ggta1P23336 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ggta1P23336 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ggta1P23336 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ggta1P23336 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ggta1P23336 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ggta1P23336 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ggta1P23336 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ggta1P23336 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ggta1P23336 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ggta1P23336 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ggta1P23336 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ggta1P23336 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ggta1P23336 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ggta1P23336 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ggta1P23336 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ggta1P23336 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ggta1P23336 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ggta1P23336 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ggta1P23336 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ggta1P23336 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ggta1P23336 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ggta1P23336 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ggta1P23336 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ggta1P23336 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ggta1P23336 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ggta1P23336 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ggta1P23336 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ggta1P23336 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ggta1P23336 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ggta1P23336 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ggta1P23336 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ggta1P23336 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ggta1P23336 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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