Protein–RNA interactions for Protein: P21855

Cd72, B-cell differentiation antigen CD72, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd72P21855 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cd72P21855 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cd72P21855 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cd72P21855 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cd72P21855 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cd72P21855 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Cd72P21855 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cd72P21855 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cd72P21855 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cd72P21855 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cd72P21855 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cd72P21855 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cd72P21855 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cd72P21855 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cd72P21855 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cd72P21855 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cd72P21855 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cd72P21855 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cd72P21855 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cd72P21855 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cd72P21855 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cd72P21855 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Cd72P21855 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cd72P21855 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cd72P21855 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cd72P21855 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cd72P21855 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cd72P21855 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cd72P21855 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cd72P21855 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cd72P21855 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cd72P21855 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cd72P21855 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cd72P21855 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cd72P21855 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cd72P21855 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cd72P21855 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cd72P21855 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cd72P21855 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cd72P21855 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cd72P21855 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cd72P21855 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cd72P21855 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cd72P21855 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cd72P21855 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cd72P21855 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cd72P21855 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cd72P21855 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cd72P21855 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cd72P21855 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cd72P21855 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cd72P21855 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cd72P21855 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cd72P21855 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cd72P21855 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cd72P21855 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cd72P21855 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cd72P21855 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cd72P21855 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cd72P21855 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cd72P21855 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cd72P21855 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cd72P21855 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cd72P21855 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cd72P21855 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cd72P21855 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cd72P21855 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cd72P21855 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cd72P21855 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cd72P21855 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cd72P21855 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cd72P21855 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cd72P21855 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cd72P21855 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cd72P21855 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cd72P21855 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cd72P21855 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cd72P21855 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cd72P21855 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cd72P21855 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cd72P21855 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cd72P21855 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cd72P21855 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cd72P21855 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cd72P21855 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cd72P21855 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cd72P21855 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cd72P21855 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cd72P21855 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cd72P21855 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cd72P21855 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cd72P21855 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cd72P21855 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cd72P21855 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cd72P21855 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cd72P21855 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Cd72P21855 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cd72P21855 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cd72P21855 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cd72P21855 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms