Protein–RNA interactions for Protein: P19785

Esr1, Estrogen receptor, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esr1P19785 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Esr1P19785 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Esr1P19785 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Esr1P19785 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Esr1P19785 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Esr1P19785 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Esr1P19785 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Esr1P19785 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Esr1P19785 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Esr1P19785 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Esr1P19785 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Esr1P19785 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Esr1P19785 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Esr1P19785 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Esr1P19785 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Esr1P19785 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Esr1P19785 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Esr1P19785 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Esr1P19785 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Esr1P19785 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Esr1P19785 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Esr1P19785 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Esr1P19785 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Esr1P19785 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Esr1P19785 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Esr1P19785 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Esr1P19785 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Esr1P19785 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Esr1P19785 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Esr1P19785 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Esr1P19785 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Esr1P19785 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Esr1P19785 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Esr1P19785 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Esr1P19785 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Esr1P19785 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Esr1P19785 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Esr1P19785 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Esr1P19785 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Esr1P19785 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Esr1P19785 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Esr1P19785 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Esr1P19785 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Esr1P19785 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Esr1P19785 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Esr1P19785 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Esr1P19785 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Esr1P19785 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Esr1P19785 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Esr1P19785 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Esr1P19785 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Esr1P19785 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Esr1P19785 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Esr1P19785 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Esr1P19785 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Esr1P19785 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Esr1P19785 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Esr1P19785 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Esr1P19785 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Esr1P19785 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Esr1P19785 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Esr1P19785 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Esr1P19785 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Esr1P19785 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Esr1P19785 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Esr1P19785 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Esr1P19785 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Esr1P19785 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Esr1P19785 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Esr1P19785 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Esr1P19785 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Esr1P19785 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Esr1P19785 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Esr1P19785 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Esr1P19785 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Esr1P19785 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Esr1P19785 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Esr1P19785 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Esr1P19785 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Esr1P19785 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Esr1P19785 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Esr1P19785 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Esr1P19785 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Esr1P19785 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Esr1P19785 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Esr1P19785 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Esr1P19785 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Esr1P19785 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Esr1P19785 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Esr1P19785 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Esr1P19785 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Esr1P19785 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Esr1P19785 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Esr1P19785 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Esr1P19785 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Esr1P19785 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Esr1P19785 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Esr1P19785 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Esr1P19785 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Esr1P19785 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms