Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csn1s1P19228 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csn1s1P19228 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csn1s1P19228 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csn1s1P19228 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csn1s1P19228 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csn1s1P19228 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csn1s1P19228 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csn1s1P19228 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csn1s1P19228 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csn1s1P19228 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csn1s1P19228 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csn1s1P19228 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csn1s1P19228 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Csn1s1P19228 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Csn1s1P19228 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Csn1s1P19228 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Csn1s1P19228 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Csn1s1P19228 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Csn1s1P19228 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csn1s1P19228 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csn1s1P19228 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csn1s1P19228 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csn1s1P19228 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Csn1s1P19228 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Csn1s1P19228 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Csn1s1P19228 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Csn1s1P19228 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Csn1s1P19228 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Csn1s1P19228 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Csn1s1P19228 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csn1s1P19228 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csn1s1P19228 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csn1s1P19228 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csn1s1P19228 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csn1s1P19228 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Csn1s1P19228 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csn1s1P19228 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csn1s1P19228 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csn1s1P19228 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csn1s1P19228 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csn1s1P19228 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csn1s1P19228 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csn1s1P19228 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csn1s1P19228 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csn1s1P19228 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csn1s1P19228 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csn1s1P19228 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csn1s1P19228 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csn1s1P19228 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csn1s1P19228 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csn1s1P19228 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csn1s1P19228 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csn1s1P19228 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csn1s1P19228 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csn1s1P19228 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csn1s1P19228 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csn1s1P19228 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Csn1s1P19228 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csn1s1P19228 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csn1s1P19228 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csn1s1P19228 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csn1s1P19228 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csn1s1P19228 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csn1s1P19228 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csn1s1P19228 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csn1s1P19228 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csn1s1P19228 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csn1s1P19228 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csn1s1P19228 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csn1s1P19228 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csn1s1P19228 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csn1s1P19228 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csn1s1P19228 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csn1s1P19228 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csn1s1P19228 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csn1s1P19228 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Csn1s1P19228 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Csn1s1P19228 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Csn1s1P19228 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Csn1s1P19228 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Csn1s1P19228 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Csn1s1P19228 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Csn1s1P19228 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Csn1s1P19228 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Csn1s1P19228 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Csn1s1P19228 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Csn1s1P19228 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Csn1s1P19228 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Csn1s1P19228 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Csn1s1P19228 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Csn1s1P19228 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Csn1s1P19228 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Csn1s1P19228 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Csn1s1P19228 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Csn1s1P19228 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Csn1s1P19228 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Csn1s1P19228 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Csn1s1P19228 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Csn1s1P19228 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms