Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lama1P19137 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lama1P19137 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lama1P19137 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lama1P19137 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Lama1P19137 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lama1P19137 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lama1P19137 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lama1P19137 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Lama1P19137 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lama1P19137 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lama1P19137 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Lama1P19137 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lama1P19137 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lama1P19137 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lama1P19137 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lama1P19137 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lama1P19137 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lama1P19137 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lama1P19137 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lama1P19137 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lama1P19137 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lama1P19137 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lama1P19137 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lama1P19137 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lama1P19137 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lama1P19137 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lama1P19137 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lama1P19137 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lama1P19137 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lama1P19137 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lama1P19137 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lama1P19137 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lama1P19137 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lama1P19137 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lama1P19137 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lama1P19137 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lama1P19137 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lama1P19137 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lama1P19137 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lama1P19137 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lama1P19137 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lama1P19137 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lama1P19137 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lama1P19137 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lama1P19137 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lama1P19137 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lama1P19137 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lama1P19137 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lama1P19137 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lama1P19137 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lama1P19137 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lama1P19137 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lama1P19137 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lama1P19137 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lama1P19137 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lama1P19137 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lama1P19137 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lama1P19137 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lama1P19137 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lama1P19137 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lama1P19137 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lama1P19137 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lama1P19137 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lama1P19137 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lama1P19137 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lama1P19137 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lama1P19137 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lama1P19137 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lama1P19137 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lama1P19137 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lama1P19137 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lama1P19137 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lama1P19137 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lama1P19137 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lama1P19137 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lama1P19137 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lama1P19137 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lama1P19137 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lama1P19137 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lama1P19137 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lama1P19137 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lama1P19137 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lama1P19137 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lama1P19137 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lama1P19137 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lama1P19137 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lama1P19137 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lama1P19137 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lama1P19137 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lama1P19137 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lama1P19137 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lama1P19137 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lama1P19137 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lama1P19137 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lama1P19137 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lama1P19137 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lama1P19137 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lama1P19137 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lama1P19137 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms