Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RargP18911 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RargP18911 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RargP18911 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RargP18911 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RargP18911 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RargP18911 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RargP18911 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RargP18911 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RargP18911 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RargP18911 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RargP18911 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RargP18911 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RargP18911 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RargP18911 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RargP18911 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RargP18911 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RargP18911 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RargP18911 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RargP18911 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RargP18911 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RargP18911 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RargP18911 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RargP18911 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RargP18911 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RargP18911 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RargP18911 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RargP18911 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RargP18911 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RargP18911 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RargP18911 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RargP18911 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RargP18911 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RargP18911 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RargP18911 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RargP18911 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RargP18911 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RargP18911 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RargP18911 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RargP18911 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RargP18911 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RargP18911 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RargP18911 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RargP18911 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RargP18911 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RargP18911 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RargP18911 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RargP18911 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RargP18911 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RargP18911 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RargP18911 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RargP18911 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RargP18911 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RargP18911 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RargP18911 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RargP18911 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RargP18911 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RargP18911 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RargP18911 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RargP18911 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RargP18911 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RargP18911 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RargP18911 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RargP18911 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RargP18911 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RargP18911 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RargP18911 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RargP18911 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RargP18911 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RargP18911 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RargP18911 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RargP18911 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RargP18911 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RargP18911 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RargP18911 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RargP18911 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RargP18911 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RargP18911 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RargP18911 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RargP18911 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RargP18911 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RargP18911 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RargP18911 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RargP18911 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RargP18911 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RargP18911 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RargP18911 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RargP18911 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RargP18911 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RargP18911 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RargP18911 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RargP18911 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RargP18911 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RargP18911 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RargP18911 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RargP18911 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RargP18911 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RargP18911 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RargP18911 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RargP18911 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 181.8 ms