Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P18529 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P18529 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P18529 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P18529 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P18529 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P18529 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P18529 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
P18529 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P18529 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P18529 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
P18529 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P18529 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P18529 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P18529 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P18529 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P18529 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P18529 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P18529 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P18529 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P18529 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P18529 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P18529 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P18529 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P18529 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P18529 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P18529 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P18529 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P18529 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P18529 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P18529 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P18529 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P18529 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P18529 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P18529 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
P18529 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P18529 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P18529 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P18529 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
P18529 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P18529 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P18529 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P18529 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P18529 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P18529 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P18529 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P18529 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P18529 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P18529 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P18529 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P18529 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P18529 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P18529 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P18529 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P18529 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P18529 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P18529 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P18529 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P18529 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P18529 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P18529 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P18529 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P18529 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P18529 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P18529 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P18529 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P18529 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P18529 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P18529 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P18529 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P18529 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P18529 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P18529 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P18529 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
P18529 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P18529 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P18529 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P18529 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P18529 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P18529 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P18529 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P18529 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P18529 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
P18529 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P18529 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P18529 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P18529 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P18529 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P18529 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P18529 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P18529 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P18529 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P18529 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P18529 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P18529 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P18529 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P18529 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P18529 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P18529 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P18529 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms