Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P18524 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P18524 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
P18524 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P18524 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P18524 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P18524 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P18524 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
P18524 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P18524 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
P18524 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P18524 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P18524 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
P18524 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
P18524 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P18524 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P18524 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
P18524 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P18524 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P18524 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P18524 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
P18524 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
P18524 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
P18524 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
P18524 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
P18524 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
P18524 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
P18524 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P18524 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P18524 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
P18524 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P18524 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P18524 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P18524 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P18524 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
P18524 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P18524 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P18524 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P18524 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
P18524 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P18524 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
P18524 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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P18524 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P18524 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P18524 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P18524 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P18524 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
P18524 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P18524 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P18524 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
P18524 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P18524 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P18524 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
P18524 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
P18524 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P18524 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P18524 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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P18524 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P18524 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
P18524 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P18524 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P18524 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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P18524 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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P18524 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
P18524 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
P18524 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
P18524 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
P18524 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
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P18524 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
P18524 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
P18524 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
P18524 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P18524 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20■□□□□ 0.79
P18524 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P18524 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
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P18524 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
P18524 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
P18524 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
P18524 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
P18524 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
P18524 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
P18524 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
P18524 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
P18524 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
P18524 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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P18524 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
P18524 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
P18524 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
P18524 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
P18524 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
P18524 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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