Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gata1P17679 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gata1P17679 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gata1P17679 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gata1P17679 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gata1P17679 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gata1P17679 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gata1P17679 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gata1P17679 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gata1P17679 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gata1P17679 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gata1P17679 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gata1P17679 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gata1P17679 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gata1P17679 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gata1P17679 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gata1P17679 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gata1P17679 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gata1P17679 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gata1P17679 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gata1P17679 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gata1P17679 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gata1P17679 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gata1P17679 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gata1P17679 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gata1P17679 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gata1P17679 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gata1P17679 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gata1P17679 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gata1P17679 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gata1P17679 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gata1P17679 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gata1P17679 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gata1P17679 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gata1P17679 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gata1P17679 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gata1P17679 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gata1P17679 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gata1P17679 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gata1P17679 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gata1P17679 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gata1P17679 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gata1P17679 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gata1P17679 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gata1P17679 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gata1P17679 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gata1P17679 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gata1P17679 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gata1P17679 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gata1P17679 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gata1P17679 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gata1P17679 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gata1P17679 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata1P17679 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata1P17679 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata1P17679 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata1P17679 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata1P17679 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata1P17679 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata1P17679 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata1P17679 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata1P17679 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata1P17679 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata1P17679 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata1P17679 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata1P17679 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata1P17679 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata1P17679 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata1P17679 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata1P17679 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata1P17679 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata1P17679 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata1P17679 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata1P17679 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata1P17679 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata1P17679 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata1P17679 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gata1P17679 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gata1P17679 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gata1P17679 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gata1P17679 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gata1P17679 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gata1P17679 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gata1P17679 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gata1P17679 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gata1P17679 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gata1P17679 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gata1P17679 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gata1P17679 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gata1P17679 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gata1P17679 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gata1P17679 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gata1P17679 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gata1P17679 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata1P17679 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata1P17679 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata1P17679 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata1P17679 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata1P17679 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata1P17679 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94 ms