Protein–RNA interactions for Protein: P14097

Ccl4, C-C motif chemokine 4, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl4P14097 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccl4P14097 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccl4P14097 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccl4P14097 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccl4P14097 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccl4P14097 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccl4P14097 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccl4P14097 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccl4P14097 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccl4P14097 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccl4P14097 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccl4P14097 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccl4P14097 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccl4P14097 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccl4P14097 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccl4P14097 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccl4P14097 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccl4P14097 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccl4P14097 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccl4P14097 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccl4P14097 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccl4P14097 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccl4P14097 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccl4P14097 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccl4P14097 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccl4P14097 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccl4P14097 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccl4P14097 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccl4P14097 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccl4P14097 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccl4P14097 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccl4P14097 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccl4P14097 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccl4P14097 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccl4P14097 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccl4P14097 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccl4P14097 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccl4P14097 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccl4P14097 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccl4P14097 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccl4P14097 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccl4P14097 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccl4P14097 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccl4P14097 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccl4P14097 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccl4P14097 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccl4P14097 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccl4P14097 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccl4P14097 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccl4P14097 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccl4P14097 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccl4P14097 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccl4P14097 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccl4P14097 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccl4P14097 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccl4P14097 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccl4P14097 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccl4P14097 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccl4P14097 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccl4P14097 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccl4P14097 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccl4P14097 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccl4P14097 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccl4P14097 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccl4P14097 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccl4P14097 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccl4P14097 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccl4P14097 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccl4P14097 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccl4P14097 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccl4P14097 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccl4P14097 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccl4P14097 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccl4P14097 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccl4P14097 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccl4P14097 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccl4P14097 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccl4P14097 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccl4P14097 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccl4P14097 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccl4P14097 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccl4P14097 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccl4P14097 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccl4P14097 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccl4P14097 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccl4P14097 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccl4P14097 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccl4P14097 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccl4P14097 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccl4P14097 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccl4P14097 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccl4P14097 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccl4P14097 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccl4P14097 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccl4P14097 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccl4P14097 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccl4P14097 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccl4P14097 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccl4P14097 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccl4P14097 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms