Protein–RNA interactions for Protein: P12960

Cntn1, Contactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn1P12960 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cntn1P12960 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cntn1P12960 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cntn1P12960 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cntn1P12960 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cntn1P12960 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cntn1P12960 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cntn1P12960 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cntn1P12960 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cntn1P12960 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cntn1P12960 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cntn1P12960 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cntn1P12960 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cntn1P12960 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cntn1P12960 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cntn1P12960 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cntn1P12960 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cntn1P12960 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cntn1P12960 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cntn1P12960 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cntn1P12960 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cntn1P12960 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cntn1P12960 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cntn1P12960 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cntn1P12960 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cntn1P12960 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cntn1P12960 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cntn1P12960 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cntn1P12960 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cntn1P12960 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cntn1P12960 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cntn1P12960 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cntn1P12960 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cntn1P12960 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cntn1P12960 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cntn1P12960 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntn1P12960 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntn1P12960 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntn1P12960 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntn1P12960 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cntn1P12960 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cntn1P12960 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cntn1P12960 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cntn1P12960 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cntn1P12960 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cntn1P12960 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cntn1P12960 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cntn1P12960 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cntn1P12960 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cntn1P12960 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cntn1P12960 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cntn1P12960 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cntn1P12960 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cntn1P12960 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cntn1P12960 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cntn1P12960 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cntn1P12960 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cntn1P12960 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cntn1P12960 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cntn1P12960 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cntn1P12960 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cntn1P12960 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cntn1P12960 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cntn1P12960 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cntn1P12960 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cntn1P12960 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cntn1P12960 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cntn1P12960 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cntn1P12960 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Cntn1P12960 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cntn1P12960 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cntn1P12960 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cntn1P12960 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cntn1P12960 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cntn1P12960 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cntn1P12960 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cntn1P12960 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cntn1P12960 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntn1P12960 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntn1P12960 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntn1P12960 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntn1P12960 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntn1P12960 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntn1P12960 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntn1P12960 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntn1P12960 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntn1P12960 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntn1P12960 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntn1P12960 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntn1P12960 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntn1P12960 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cntn1P12960 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cntn1P12960 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cntn1P12960 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cntn1P12960 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cntn1P12960 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cntn1P12960 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cntn1P12960 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cntn1P12960 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cntn1P12960 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms