Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PolP11369 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PolP11369 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PolP11369 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PolP11369 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PolP11369 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PolP11369 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PolP11369 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PolP11369 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PolP11369 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PolP11369 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PolP11369 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PolP11369 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PolP11369 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PolP11369 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PolP11369 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PolP11369 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PolP11369 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PolP11369 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PolP11369 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PolP11369 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PolP11369 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PolP11369 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PolP11369 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PolP11369 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PolP11369 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PolP11369 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PolP11369 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PolP11369 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PolP11369 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PolP11369 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PolP11369 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PolP11369 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PolP11369 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PolP11369 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PolP11369 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PolP11369 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PolP11369 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PolP11369 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PolP11369 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PolP11369 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PolP11369 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PolP11369 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PolP11369 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PolP11369 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PolP11369 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PolP11369 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PolP11369 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PolP11369 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PolP11369 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PolP11369 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PolP11369 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PolP11369 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PolP11369 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PolP11369 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PolP11369 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PolP11369 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PolP11369 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PolP11369 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PolP11369 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PolP11369 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PolP11369 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PolP11369 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PolP11369 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PolP11369 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PolP11369 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PolP11369 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PolP11369 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PolP11369 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PolP11369 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PolP11369 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PolP11369 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PolP11369 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PolP11369 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PolP11369 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PolP11369 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PolP11369 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PolP11369 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PolP11369 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PolP11369 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PolP11369 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PolP11369 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PolP11369 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PolP11369 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PolP11369 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PolP11369 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PolP11369 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PolP11369 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PolP11369 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PolP11369 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PolP11369 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PolP11369 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PolP11369 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PolP11369 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PolP11369 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PolP11369 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PolP11369 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PolP11369 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PolP11369 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PolP11369 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms