Protein–RNA interactions for Protein: P11103

Parp1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp1P11103 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Parp1P11103 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Parp1P11103 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Parp1P11103 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Parp1P11103 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Parp1P11103 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Parp1P11103 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Parp1P11103 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Parp1P11103 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Parp1P11103 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Parp1P11103 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Parp1P11103 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Parp1P11103 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Parp1P11103 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Parp1P11103 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Parp1P11103 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Parp1P11103 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Parp1P11103 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Parp1P11103 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Parp1P11103 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Parp1P11103 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Parp1P11103 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Parp1P11103 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Parp1P11103 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Parp1P11103 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Parp1P11103 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Parp1P11103 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Parp1P11103 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Parp1P11103 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Parp1P11103 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Parp1P11103 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Parp1P11103 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Parp1P11103 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Parp1P11103 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Parp1P11103 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Parp1P11103 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Parp1P11103 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Parp1P11103 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Parp1P11103 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Parp1P11103 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Parp1P11103 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Parp1P11103 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Parp1P11103 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Parp1P11103 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Parp1P11103 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Parp1P11103 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Parp1P11103 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Parp1P11103 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Parp1P11103 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Parp1P11103 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Parp1P11103 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Parp1P11103 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Parp1P11103 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Parp1P11103 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Parp1P11103 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Parp1P11103 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Parp1P11103 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Parp1P11103 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Parp1P11103 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Parp1P11103 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Parp1P11103 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Parp1P11103 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Parp1P11103 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Parp1P11103 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Parp1P11103 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Parp1P11103 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Parp1P11103 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Parp1P11103 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Parp1P11103 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Parp1P11103 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Parp1P11103 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Parp1P11103 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Parp1P11103 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Parp1P11103 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Parp1P11103 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Parp1P11103 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Parp1P11103 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Parp1P11103 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Parp1P11103 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Parp1P11103 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Parp1P11103 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Parp1P11103 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Parp1P11103 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Parp1P11103 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Parp1P11103 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Parp1P11103 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Parp1P11103 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Parp1P11103 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Parp1P11103 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Parp1P11103 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Parp1P11103 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Parp1P11103 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Parp1P11103 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Parp1P11103 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Parp1P11103 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Parp1P11103 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Parp1P11103 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Parp1P11103 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Parp1P11103 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Parp1P11103 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms