Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prf1P10820 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prf1P10820 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prf1P10820 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Prf1P10820 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prf1P10820 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Prf1P10820 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prf1P10820 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prf1P10820 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prf1P10820 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prf1P10820 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prf1P10820 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prf1P10820 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prf1P10820 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Prf1P10820 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prf1P10820 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prf1P10820 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prf1P10820 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prf1P10820 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prf1P10820 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prf1P10820 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prf1P10820 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prf1P10820 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prf1P10820 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prf1P10820 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prf1P10820 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prf1P10820 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prf1P10820 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prf1P10820 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prf1P10820 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prf1P10820 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Prf1P10820 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Prf1P10820 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Prf1P10820 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prf1P10820 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prf1P10820 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prf1P10820 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prf1P10820 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prf1P10820 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prf1P10820 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prf1P10820 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prf1P10820 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prf1P10820 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prf1P10820 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prf1P10820 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Prf1P10820 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Prf1P10820 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prf1P10820 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prf1P10820 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Prf1P10820 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prf1P10820 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prf1P10820 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prf1P10820 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Prf1P10820 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prf1P10820 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prf1P10820 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prf1P10820 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prf1P10820 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prf1P10820 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prf1P10820 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prf1P10820 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prf1P10820 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prf1P10820 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prf1P10820 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prf1P10820 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prf1P10820 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Prf1P10820 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prf1P10820 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prf1P10820 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prf1P10820 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prf1P10820 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prf1P10820 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prf1P10820 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prf1P10820 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prf1P10820 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prf1P10820 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prf1P10820 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prf1P10820 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prf1P10820 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prf1P10820 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prf1P10820 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prf1P10820 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prf1P10820 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prf1P10820 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prf1P10820 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prf1P10820 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prf1P10820 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prf1P10820 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prf1P10820 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prf1P10820 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prf1P10820 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prf1P10820 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prf1P10820 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Prf1P10820 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prf1P10820 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prf1P10820 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prf1P10820 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prf1P10820 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prf1P10820 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prf1P10820 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms