Protein–RNA interactions for Protein: P10629

Hoxc6, Homeobox protein Hox-C6, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc6P10629 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hoxc6P10629 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hoxc6P10629 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hoxc6P10629 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hoxc6P10629 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hoxc6P10629 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hoxc6P10629 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hoxc6P10629 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hoxc6P10629 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hoxc6P10629 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hoxc6P10629 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hoxc6P10629 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxc6P10629 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxc6P10629 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxc6P10629 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxc6P10629 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxc6P10629 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxc6P10629 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxc6P10629 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxc6P10629 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxc6P10629 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxc6P10629 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxc6P10629 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxc6P10629 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxc6P10629 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxc6P10629 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxc6P10629 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxc6P10629 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxc6P10629 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxc6P10629 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxc6P10629 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxc6P10629 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxc6P10629 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxc6P10629 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hoxc6P10629 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hoxc6P10629 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hoxc6P10629 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hoxc6P10629 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hoxc6P10629 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hoxc6P10629 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxc6P10629 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxc6P10629 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxc6P10629 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxc6P10629 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxc6P10629 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxc6P10629 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxc6P10629 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxc6P10629 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxc6P10629 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxc6P10629 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxc6P10629 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxc6P10629 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxc6P10629 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxc6P10629 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxc6P10629 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxc6P10629 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hoxc6P10629 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hoxc6P10629 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hoxc6P10629 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hoxc6P10629 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hoxc6P10629 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hoxc6P10629 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hoxc6P10629 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxc6P10629 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxc6P10629 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxc6P10629 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxc6P10629 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxc6P10629 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxc6P10629 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxc6P10629 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxc6P10629 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxc6P10629 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxc6P10629 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxc6P10629 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxc6P10629 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxc6P10629 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxc6P10629 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxc6P10629 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxc6P10629 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxc6P10629 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxc6P10629 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxc6P10629 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxc6P10629 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxc6P10629 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxc6P10629 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxc6P10629 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxc6P10629 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxc6P10629 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxc6P10629 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxc6P10629 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxc6P10629 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxc6P10629 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxc6P10629 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxc6P10629 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxc6P10629 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxc6P10629 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxc6P10629 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxc6P10629 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxc6P10629 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxc6P10629 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms