Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

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Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolP10400 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolP10400 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolP10400 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolP10400 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolP10400 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolP10400 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolP10400 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolP10400 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolP10400 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolP10400 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolP10400 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PolP10400 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PolP10400 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PolP10400 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PolP10400 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PolP10400 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PolP10400 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PolP10400 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PolP10400 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PolP10400 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PolP10400 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PolP10400 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PolP10400 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PolP10400 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PolP10400 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PolP10400 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PolP10400 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PolP10400 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PolP10400 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PolP10400 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PolP10400 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PolP10400 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PolP10400 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PolP10400 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PolP10400 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PolP10400 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PolP10400 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PolP10400 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PolP10400 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PolP10400 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PolP10400 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PolP10400 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PolP10400 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PolP10400 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PolP10400 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PolP10400 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PolP10400 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PolP10400 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PolP10400 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PolP10400 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PolP10400 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PolP10400 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PolP10400 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PolP10400 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PolP10400 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PolP10400 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PolP10400 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PolP10400 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PolP10400 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PolP10400 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PolP10400 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PolP10400 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PolP10400 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PolP10400 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PolP10400 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PolP10400 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PolP10400 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PolP10400 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PolP10400 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PolP10400 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PolP10400 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PolP10400 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PolP10400 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PolP10400 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PolP10400 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PolP10400 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PolP10400 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PolP10400 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PolP10400 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PolP10400 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PolP10400 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PolP10400 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PolP10400 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PolP10400 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PolP10400 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PolP10400 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PolP10400 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PolP10400 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PolP10400 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PolP10400 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PolP10400 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PolP10400 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PolP10400 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PolP10400 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PolP10400 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PolP10400 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PolP10400 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PolP10400 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PolP10400 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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