Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UbbP0CG49 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UbbP0CG49 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UbbP0CG49 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UbbP0CG49 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UbbP0CG49 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UbbP0CG49 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UbbP0CG49 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UbbP0CG49 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UbbP0CG49 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UbbP0CG49 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
UbbP0CG49 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UbbP0CG49 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
UbbP0CG49 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
UbbP0CG49 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
UbbP0CG49 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UbbP0CG49 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UbbP0CG49 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UbbP0CG49 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UbbP0CG49 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UbbP0CG49 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UbbP0CG49 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UbbP0CG49 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UbbP0CG49 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UbbP0CG49 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UbbP0CG49 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UbbP0CG49 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UbbP0CG49 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UbbP0CG49 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UbbP0CG49 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
UbbP0CG49 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UbbP0CG49 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UbbP0CG49 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UbbP0CG49 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UbbP0CG49 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UbbP0CG49 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UbbP0CG49 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UbbP0CG49 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UbbP0CG49 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UbbP0CG49 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UbbP0CG49 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UbbP0CG49 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UbbP0CG49 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UbbP0CG49 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UbbP0CG49 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UbbP0CG49 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
UbbP0CG49 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UbbP0CG49 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UbbP0CG49 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UbbP0CG49 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UbbP0CG49 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UbbP0CG49 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UbbP0CG49 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UbbP0CG49 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UbbP0CG49 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UbbP0CG49 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UbbP0CG49 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UbbP0CG49 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UbbP0CG49 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UbbP0CG49 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UbbP0CG49 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UbbP0CG49 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UbbP0CG49 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UbbP0CG49 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UbbP0CG49 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UbbP0CG49 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UbbP0CG49 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UbbP0CG49 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UbbP0CG49 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UbbP0CG49 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UbbP0CG49 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UbbP0CG49 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UbbP0CG49 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UbbP0CG49 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UbbP0CG49 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UbbP0CG49 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UbbP0CG49 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UbbP0CG49 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UbbP0CG49 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UbbP0CG49 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UbbP0CG49 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UbbP0CG49 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UbbP0CG49 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UbbP0CG49 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UbbP0CG49 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UbbP0CG49 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UbbP0CG49 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UbbP0CG49 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UbbP0CG49 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UbbP0CG49 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UbbP0CG49 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UbbP0CG49 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UbbP0CG49 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UbbP0CG49 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UbbP0CG49 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UbbP0CG49 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UbbP0CG49 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
UbbP0CG49 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
UbbP0CG49 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
UbbP0CG49 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.5 ms