Protein–RNA interactions for Protein: P0C6B7

Igsf6, Immunoglobulin superfamily member 6, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf6P0C6B7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Igsf6P0C6B7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Igsf6P0C6B7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Igsf6P0C6B7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Igsf6P0C6B7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Igsf6P0C6B7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Igsf6P0C6B7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Igsf6P0C6B7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Igsf6P0C6B7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Igsf6P0C6B7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Igsf6P0C6B7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Igsf6P0C6B7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Igsf6P0C6B7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Igsf6P0C6B7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Igsf6P0C6B7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Igsf6P0C6B7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Igsf6P0C6B7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Igsf6P0C6B7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Igsf6P0C6B7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Igsf6P0C6B7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Igsf6P0C6B7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Igsf6P0C6B7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Igsf6P0C6B7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Igsf6P0C6B7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Igsf6P0C6B7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Igsf6P0C6B7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Igsf6P0C6B7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Igsf6P0C6B7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Igsf6P0C6B7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Igsf6P0C6B7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Igsf6P0C6B7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Igsf6P0C6B7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Igsf6P0C6B7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Igsf6P0C6B7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Igsf6P0C6B7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Igsf6P0C6B7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Igsf6P0C6B7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Igsf6P0C6B7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Igsf6P0C6B7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Igsf6P0C6B7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Igsf6P0C6B7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Igsf6P0C6B7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Igsf6P0C6B7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Igsf6P0C6B7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Igsf6P0C6B7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Igsf6P0C6B7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Igsf6P0C6B7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Igsf6P0C6B7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Igsf6P0C6B7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Igsf6P0C6B7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Igsf6P0C6B7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Igsf6P0C6B7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Igsf6P0C6B7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Igsf6P0C6B7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Igsf6P0C6B7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Igsf6P0C6B7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Igsf6P0C6B7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Igsf6P0C6B7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Igsf6P0C6B7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Igsf6P0C6B7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Igsf6P0C6B7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Igsf6P0C6B7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Igsf6P0C6B7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Igsf6P0C6B7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Igsf6P0C6B7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Igsf6P0C6B7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Igsf6P0C6B7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Igsf6P0C6B7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Igsf6P0C6B7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Igsf6P0C6B7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Igsf6P0C6B7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Igsf6P0C6B7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Igsf6P0C6B7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Igsf6P0C6B7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Igsf6P0C6B7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Igsf6P0C6B7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Igsf6P0C6B7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Igsf6P0C6B7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Igsf6P0C6B7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Igsf6P0C6B7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Igsf6P0C6B7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Igsf6P0C6B7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Igsf6P0C6B7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Igsf6P0C6B7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Igsf6P0C6B7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Igsf6P0C6B7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Igsf6P0C6B7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Igsf6P0C6B7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Igsf6P0C6B7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Igsf6P0C6B7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Igsf6P0C6B7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Igsf6P0C6B7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Igsf6P0C6B7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Igsf6P0C6B7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Igsf6P0C6B7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Igsf6P0C6B7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Igsf6P0C6B7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Igsf6P0C6B7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Igsf6P0C6B7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Igsf6P0C6B7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms