Protein–RNA interactions for Protein: P09803

Cdh1, Cadherin-1, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh1P09803 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdh1P09803 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdh1P09803 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdh1P09803 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdh1P09803 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdh1P09803 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdh1P09803 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdh1P09803 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdh1P09803 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdh1P09803 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdh1P09803 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdh1P09803 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdh1P09803 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdh1P09803 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdh1P09803 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdh1P09803 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdh1P09803 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdh1P09803 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdh1P09803 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdh1P09803 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdh1P09803 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdh1P09803 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdh1P09803 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdh1P09803 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdh1P09803 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdh1P09803 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdh1P09803 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdh1P09803 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdh1P09803 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh1P09803 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh1P09803 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh1P09803 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh1P09803 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh1P09803 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh1P09803 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh1P09803 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh1P09803 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh1P09803 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh1P09803 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh1P09803 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh1P09803 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh1P09803 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh1P09803 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh1P09803 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh1P09803 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdh1P09803 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh1P09803 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh1P09803 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh1P09803 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh1P09803 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh1P09803 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh1P09803 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh1P09803 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdh1P09803 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdh1P09803 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdh1P09803 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdh1P09803 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cdh1P09803 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh1P09803 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh1P09803 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh1P09803 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh1P09803 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh1P09803 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh1P09803 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh1P09803 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh1P09803 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh1P09803 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh1P09803 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh1P09803 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh1P09803 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh1P09803 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh1P09803 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh1P09803 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh1P09803 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh1P09803 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh1P09803 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh1P09803 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh1P09803 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh1P09803 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh1P09803 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh1P09803 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh1P09803 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh1P09803 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh1P09803 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh1P09803 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh1P09803 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdh1P09803 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdh1P09803 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdh1P09803 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh1P09803 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh1P09803 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh1P09803 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh1P09803 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh1P09803 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh1P09803 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh1P09803 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh1P09803 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh1P09803 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh1P09803 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh1P09803 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms