Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Hoxc9P09633 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Hoxc9P09633 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Hoxc9P09633 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Hoxc9P09633 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Hoxc9P09633 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Hoxc9P09633 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Hoxc9P09633 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Hoxc9P09633 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Hoxc9P09633 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Hoxc9P09633 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Hoxc9P09633 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Hoxc9P09633 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Hoxc9P09633 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Hoxc9P09633 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Hoxc9P09633 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Hoxc9P09633 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Hoxc9P09633 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Hoxc9P09633 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Hoxc9P09633 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Hoxc9P09633 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Hoxc9P09633 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Hoxc9P09633 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Hoxc9P09633 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Hoxc9P09633 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Hoxc9P09633 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Hoxc9P09633 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Hoxc9P09633 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Hoxc9P09633 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Hoxc9P09633 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Hoxc9P09633 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Hoxc9P09633 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Hoxc9P09633 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Hoxc9P09633 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Hoxc9P09633 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Hoxc9P09633 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Hoxc9P09633 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Hoxc9P09633 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Hoxc9P09633 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Hoxc9P09633 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Hoxc9P09633 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Hoxc9P09633 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Hoxc9P09633 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Hoxc9P09633 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Hoxc9P09633 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Hoxc9P09633 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Hoxc9P09633 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Hoxc9P09633 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Hoxc9P09633 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Hoxc9P09633 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Hoxc9P09633 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Hoxc9P09633 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Hoxc9P09633 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Hoxc9P09633 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Hoxc9P09633 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Hoxc9P09633 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Hoxc9P09633 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Hoxc9P09633 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Hoxc9P09633 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Hoxc9P09633 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Hoxc9P09633 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Hoxc9P09633 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Hoxc9P09633 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Hoxc9P09633 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Hoxc9P09633 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Hoxc9P09633 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Hoxc9P09633 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Hoxc9P09633 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Hoxc9P09633 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Hoxc9P09633 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Hoxc9P09633 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Hoxc9P09633 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Hoxc9P09633 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Hoxc9P09633 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Hoxc9P09633 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Hoxc9P09633 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Hoxc9P09633 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Hoxc9P09633 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Hoxc9P09633 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Hoxc9P09633 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Hoxc9P09633 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Hoxc9P09633 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Hoxc9P09633 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Hoxc9P09633 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Hoxc9P09633 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Hoxc9P09633 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Hoxc9P09633 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Hoxc9P09633 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Hoxc9P09633 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Hoxc9P09633 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Hoxc9P09633 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Hoxc9P09633 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Hoxc9P09633 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Hoxc9P09633 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Hoxc9P09633 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Hoxc9P09633 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Hoxc9P09633 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Hoxc9P09633 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Hoxc9P09633 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Hoxc9P09633 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms