Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxc8P09025 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxc8P09025 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxc8P09025 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxc8P09025 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxc8P09025 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxc8P09025 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxc8P09025 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxc8P09025 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxc8P09025 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxc8P09025 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxc8P09025 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxc8P09025 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxc8P09025 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxc8P09025 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxc8P09025 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxc8P09025 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxc8P09025 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxc8P09025 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxc8P09025 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxc8P09025 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxc8P09025 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxc8P09025 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxc8P09025 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxc8P09025 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxc8P09025 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxc8P09025 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxc8P09025 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hoxc8P09025 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxc8P09025 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxc8P09025 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxc8P09025 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxc8P09025 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxc8P09025 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxc8P09025 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxc8P09025 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxc8P09025 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxc8P09025 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxc8P09025 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxc8P09025 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxc8P09025 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxc8P09025 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxc8P09025 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxc8P09025 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxc8P09025 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxc8P09025 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxc8P09025 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxc8P09025 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxc8P09025 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxc8P09025 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxc8P09025 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxc8P09025 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxc8P09025 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxc8P09025 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxc8P09025 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxc8P09025 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxc8P09025 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxc8P09025 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxc8P09025 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxc8P09025 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxc8P09025 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxc8P09025 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxc8P09025 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxc8P09025 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxc8P09025 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxc8P09025 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxc8P09025 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxc8P09025 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxc8P09025 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxc8P09025 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxc8P09025 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxc8P09025 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxc8P09025 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxc8P09025 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxc8P09025 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxc8P09025 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxc8P09025 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxc8P09025 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxc8P09025 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxc8P09025 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxc8P09025 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxc8P09025 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxc8P09025 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxc8P09025 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxc8P09025 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxc8P09025 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxc8P09025 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxc8P09025 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxc8P09025 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxc8P09025 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxc8P09025 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxc8P09025 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxc8P09025 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxc8P09025 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxc8P09025 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxc8P09025 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxc8P09025 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxc8P09025 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxc8P09025 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxc8P09025 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms