Protein–RNA interactions for Protein: P09022

Hoxa1, Homeobox protein Hox-A1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa1P09022 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa1P09022 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa1P09022 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa1P09022 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa1P09022 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa1P09022 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa1P09022 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa1P09022 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa1P09022 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa1P09022 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa1P09022 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa1P09022 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa1P09022 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa1P09022 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa1P09022 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa1P09022 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa1P09022 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa1P09022 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa1P09022 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa1P09022 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa1P09022 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa1P09022 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa1P09022 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxa1P09022 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxa1P09022 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa1P09022 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa1P09022 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa1P09022 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa1P09022 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa1P09022 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa1P09022 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa1P09022 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa1P09022 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa1P09022 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa1P09022 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa1P09022 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa1P09022 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa1P09022 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa1P09022 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa1P09022 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa1P09022 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa1P09022 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa1P09022 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa1P09022 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa1P09022 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa1P09022 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa1P09022 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa1P09022 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa1P09022 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa1P09022 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa1P09022 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa1P09022 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa1P09022 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa1P09022 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa1P09022 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa1P09022 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa1P09022 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa1P09022 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa1P09022 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa1P09022 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa1P09022 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa1P09022 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa1P09022 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa1P09022 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa1P09022 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa1P09022 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa1P09022 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa1P09022 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa1P09022 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa1P09022 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa1P09022 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa1P09022 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa1P09022 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa1P09022 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa1P09022 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa1P09022 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa1P09022 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa1P09022 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa1P09022 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa1P09022 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa1P09022 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa1P09022 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa1P09022 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa1P09022 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa1P09022 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa1P09022 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa1P09022 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa1P09022 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa1P09022 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa1P09022 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa1P09022 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa1P09022 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa1P09022 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa1P09022 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa1P09022 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa1P09022 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa1P09022 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa1P09022 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa1P09022 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa1P09022 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms