Protein–RNA interactions for Protein: P08042

Zfp1, Zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp1P08042 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zfp1P08042 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zfp1P08042 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zfp1P08042 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zfp1P08042 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zfp1P08042 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp1P08042 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp1P08042 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp1P08042 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp1P08042 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zfp1P08042 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zfp1P08042 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zfp1P08042 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp1P08042 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp1P08042 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp1P08042 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp1P08042 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp1P08042 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zfp1P08042 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zfp1P08042 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zfp1P08042 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zfp1P08042 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zfp1P08042 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp1P08042 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp1P08042 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp1P08042 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp1P08042 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp1P08042 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp1P08042 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp1P08042 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp1P08042 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp1P08042 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp1P08042 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp1P08042 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp1P08042 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp1P08042 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp1P08042 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp1P08042 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp1P08042 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp1P08042 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp1P08042 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp1P08042 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp1P08042 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp1P08042 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfp1P08042 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfp1P08042 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Zfp1P08042 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp1P08042 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp1P08042 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp1P08042 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp1P08042 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp1P08042 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp1P08042 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp1P08042 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp1P08042 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp1P08042 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp1P08042 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp1P08042 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp1P08042 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp1P08042 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp1P08042 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp1P08042 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp1P08042 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp1P08042 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp1P08042 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp1P08042 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp1P08042 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp1P08042 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp1P08042 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp1P08042 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp1P08042 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp1P08042 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp1P08042 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp1P08042 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp1P08042 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp1P08042 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp1P08042 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp1P08042 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp1P08042 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp1P08042 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp1P08042 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp1P08042 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp1P08042 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp1P08042 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp1P08042 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp1P08042 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp1P08042 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp1P08042 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp1P08042 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp1P08042 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp1P08042 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp1P08042 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp1P08042 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp1P08042 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp1P08042 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp1P08042 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp1P08042 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp1P08042 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp1P08042 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp1P08042 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms