Protein–RNA interactions for Protein: P07744

Krt4, Keratin, type II cytoskeletal 4, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt4P07744 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt4P07744 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt4P07744 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Krt4P07744 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt4P07744 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt4P07744 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt4P07744 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt4P07744 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt4P07744 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt4P07744 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt4P07744 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt4P07744 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt4P07744 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt4P07744 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt4P07744 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt4P07744 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt4P07744 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt4P07744 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt4P07744 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt4P07744 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt4P07744 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt4P07744 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt4P07744 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt4P07744 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt4P07744 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt4P07744 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt4P07744 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt4P07744 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt4P07744 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt4P07744 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt4P07744 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt4P07744 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt4P07744 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt4P07744 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt4P07744 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt4P07744 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt4P07744 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt4P07744 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt4P07744 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Krt4P07744 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt4P07744 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt4P07744 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt4P07744 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt4P07744 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt4P07744 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt4P07744 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt4P07744 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt4P07744 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt4P07744 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt4P07744 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt4P07744 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt4P07744 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt4P07744 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt4P07744 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt4P07744 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt4P07744 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt4P07744 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt4P07744 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt4P07744 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt4P07744 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt4P07744 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt4P07744 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt4P07744 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt4P07744 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt4P07744 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt4P07744 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt4P07744 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt4P07744 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt4P07744 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt4P07744 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt4P07744 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt4P07744 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt4P07744 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt4P07744 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt4P07744 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt4P07744 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt4P07744 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt4P07744 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Krt4P07744 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt4P07744 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt4P07744 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt4P07744 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt4P07744 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt4P07744 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt4P07744 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt4P07744 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt4P07744 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt4P07744 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt4P07744 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt4P07744 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt4P07744 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt4P07744 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt4P07744 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt4P07744 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt4P07744 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt4P07744 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt4P07744 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt4P07744 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt4P07744 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt4P07744 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms