Protein–RNA interactions for Protein: P06880

Gh1, Somatotropin, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gh1P06880 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gh1P06880 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gh1P06880 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gh1P06880 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gh1P06880 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gh1P06880 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gh1P06880 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gh1P06880 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gh1P06880 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gh1P06880 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gh1P06880 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gh1P06880 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gh1P06880 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gh1P06880 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gh1P06880 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gh1P06880 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gh1P06880 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gh1P06880 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gh1P06880 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gh1P06880 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gh1P06880 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gh1P06880 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gh1P06880 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gh1P06880 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gh1P06880 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gh1P06880 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gh1P06880 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gh1P06880 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gh1P06880 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gh1P06880 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gh1P06880 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gh1P06880 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gh1P06880 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gh1P06880 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gh1P06880 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gh1P06880 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gh1P06880 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gh1P06880 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gh1P06880 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gh1P06880 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gh1P06880 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gh1P06880 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gh1P06880 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gh1P06880 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gh1P06880 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gh1P06880 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gh1P06880 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gh1P06880 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gh1P06880 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gh1P06880 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gh1P06880 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gh1P06880 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gh1P06880 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gh1P06880 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gh1P06880 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gh1P06880 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gh1P06880 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gh1P06880 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gh1P06880 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gh1P06880 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gh1P06880 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gh1P06880 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gh1P06880 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gh1P06880 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gh1P06880 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gh1P06880 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gh1P06880 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gh1P06880 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gh1P06880 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gh1P06880 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gh1P06880 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gh1P06880 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gh1P06880 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gh1P06880 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gh1P06880 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gh1P06880 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gh1P06880 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gh1P06880 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gh1P06880 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gh1P06880 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gh1P06880 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gh1P06880 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gh1P06880 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gh1P06880 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gh1P06880 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gh1P06880 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gh1P06880 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gh1P06880 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gh1P06880 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gh1P06880 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gh1P06880 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gh1P06880 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gh1P06880 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gh1P06880 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gh1P06880 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Gh1P06880 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gh1P06880 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gh1P06880 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gh1P06880 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gh1P06880 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms